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doukezhiwu

木虫 (著名写手)


rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-11-02 08:11:32
如果你用treecon软件,选择大于50的显示,就不会出现这个情况了。还有就是刻度的选择是个问题,就是核苷酸替代数要换。
11楼2011-09-24 00:07:20
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angel_wff

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhang8826857(金币+5): 鼓励新虫 2011-11-03 03:52:17
下面那个0.0005是什么意思,什么样的是合适,应该怎么改,我是做鉴定种的,我把这个菌种的序列测出来,然后在GENEBANK里搜索,同源性高的我就下载下来,然后比对,建分子发育树,置信度就很低,我用其他的序列试,我要鉴定的这个菌种,一会和这个聚在了一起,一会和那个聚在了一起,是什么原因?求高手解答。
12楼2011-09-24 11:05:12
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冰鱼儿

金虫 (正式写手)

引用回帖:
12楼: Originally posted by angel_wff at 2011-09-24 11:05:12:
下面那个0.0005是什么意思,什么样的是合适,应该怎么改,我是做鉴定种的,我把这个菌种的序列测出来,然后在GENEBANK里搜索,同源性高的我就下载下来,然后比对,建分子发育树,置信度就很低,我用其他的序列试, ...

我也有同样的疑惑,你做的是真菌还是细菌?
13楼2011-09-24 15:08:30
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angel_wff

新虫 (初入文坛)

我做的是真菌
14楼2011-09-24 16:10:25
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冰鱼儿

金虫 (正式写手)

引用回帖:
14楼: Originally posted by angel_wff at 2011-09-24 16:10:25:
我做的是真菌

我也是啊
15楼2011-09-24 21:14:53
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wantingzhang

银虫 (小有名气)

我也是做真菌的,同求,你们解决了吗?
再伟大的梦想也不够最彻底的坚持厉害
16楼2011-10-21 19:39:12
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-11-02 08:11:45
将两头差异的序列尽量切掉,再将比对后产生的空位去除后再试
17楼2011-11-02 01:01:19
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冰鱼儿

金虫 (正式写手)

引用回帖:
17楼: Originally posted by niyq at 2011-11-02 01:01:19:
将两头差异的序列尽量切掉,再将比对后产生的空位去除后再试

怎样去掉呢?
18楼2011-11-02 09:53:33
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zhang8826857(金币+2): 鼓励应助 2011-11-03 03:52:30
在软件中序列比对完之后,在编辑中有一个去除gaps的功能,cluatal就有
19楼2011-11-02 23:46:12
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ycj0746

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

找同源性比较高的序列,比对的时候去头去尾,然后再换不同的建树方法试试,应该基本就这些了.
20楼2011-11-05 10:25:26
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