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doukezhiwu

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★
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-11-02 08:11:32

如果你用treecon软件，选择大于50的显示，就不会出现这个情况了。还有就是刻度的选择是个问题，就是核苷酸替代数要换。

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11楼2011-09-24 00:07:20

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angel_wff

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhang8826857(金币+5): 鼓励新虫 2011-11-03 03:52:17

下面那个0.0005是什么意思，什么样的是合适，应该怎么改，我是做鉴定种的，我把这个菌种的序列测出来，然后在GENEBANK里搜索，同源性高的我就下载下来，然后比对，建分子发育树，置信度就很低，我用其他的序列试，我要鉴定的这个菌种，一会和这个聚在了一起，一会和那个聚在了一起，是什么原因？求高手解答。

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12楼2011-09-24 11:05:12

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冰鱼儿

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12楼: Originally posted by angel_wff at 2011-09-24 11:05:12:
下面那个0.0005是什么意思，什么样的是合适，应该怎么改，我是做鉴定种的，我把这个菌种的序列测出来，然后在GENEBANK里搜索，同源性高的我就下载下来，然后比对，建分子发育树，置信度就很低，我用其他的序列试， ...

我也有同样的疑惑，你做的是真菌还是细菌？

13楼2011-09-24 15:08:30

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angel_wff

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我做的是真菌

14楼2011-09-24 16:10:25

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冰鱼儿

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14楼: Originally posted by angel_wff at 2011-09-24 16:10:25:
我做的是真菌

我也是啊

15楼2011-09-24 21:14:53

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wantingzhang

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我也是做真菌的，同求，你们解决了吗？

再伟大的梦想也不够最彻底的坚持厉害

16楼2011-10-21 19:39:12

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niyq

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【答案】应助回帖

★
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-11-02 08:11:45

将两头差异的序列尽量切掉，再将比对后产生的空位去除后再试

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17楼2011-11-02 01:01:19

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冰鱼儿

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17楼: Originally posted by niyq at 2011-11-02 01:01:19:
将两头差异的序列尽量切掉，再将比对后产生的空位去除后再试

怎样去掉呢？

18楼2011-11-02 09:53:33

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niyq

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【答案】应助回帖

★ ★
zhang8826857(金币+2): 鼓励应助 2011-11-03 03:52:30

在软件中序列比对完之后，在编辑中有一个去除gaps的功能，cluatal就有

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19楼2011-11-02 23:46:12

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ycj0746

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【答案】应助回帖

找同源性比较高的序列,比对的时候去头去尾,然后再换不同的建树方法试试,应该基本就这些了.

20楼2011-11-05 10:25:26

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