24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 8056  |  回复: 34
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

molly20123832

新虫 (初入文坛)

[求助] 建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊?送金币 已有2人参与

我在建系统发育树时,先是在ncbi上通过blast找到相似度在96%-99%的序列,然后编辑好后用bioedit切头切尾,再用mega4进行建树,用的是NJ法,可是为什么建好的树置信度那么低呢,有些只有30多?还有就是写文章时用的图是original tree 还是bootstrap consensus tree?求高人指点~不要说写理论的(像我在百度搜了好多次都是摆一大堆道理,没实际指导),图下
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ycj0746

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

找同源性比较高的序列,比对的时候去头去尾,然后再换不同的建树方法试试,应该基本就这些了.
20楼2011-11-05 10:25:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 35 个回答

my0528

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我也在做这方面,也有同样的疑问,初次建树很多都不懂,望做这方面的回帖啊
宁静以致远
2楼2011-09-15 17:25:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xinongfish

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-11-02 08:10:58
调整一下比对的单位长度等参数,或许能提高分数
4楼2011-09-17 10:06:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天鸟

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-11-02 08:11:05
有没有Cluster W比对呀?很多别人建的进化树是将小于50的数值就不显示。另外再找些同属的菌再试试,祝好
快乐生活,我快乐
6楼2011-09-17 15:17:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 08工科求调剂290分 +5 1314捧花 2026-04-02 8/400 2026-04-02 13:16 by 乔哒哒哒
[考研] 321求调剂 一志愿 浙江工业大学生物医药 +3 嘿嘿HC 2026-04-01 4/200 2026-04-02 13:12 by syh9288
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358 +8 cs0106 2026-04-01 9/450 2026-04-02 10:36 by 不吃魚的貓
[考研] 材料考研调剂 +9 Gs大王 2026-04-02 9/450 2026-04-02 10:24 by olim
[考研] 085600,材料与化工321分调剂 +8 大馋小子 2026-03-27 10/500 2026-04-02 10:15 by kaiyanjie
[考研] 生物学327,求调剂 +5 书上的梅子 2026-04-01 6/300 2026-04-02 06:47 by ilovexiaobin
[考研] 284求调剂 +12 小熊~~ 2026-03-31 12/600 2026-04-01 20:23 by 花??
[考研] 267求调剂 +13 uiybh 2026-03-31 13/650 2026-04-01 10:25 by 探123
[考研] 一志愿武理材料工程302调剂环化或化工 +15 Doleres 2026-03-31 16/800 2026-04-01 09:49 by lfj11
[考研] 070300化学专业279调剂 +10 哈哈哈^_^ 2026-03-31 10/500 2026-03-31 23:13 by liu823948201
[考研] 考研调剂求助 +7 13287130938 2026-03-31 7/350 2026-03-31 16:39 by 690616278
[考研] 求化学调剂 +12 wulanna 2026-03-28 12/600 2026-03-31 16:38 by 690616278
[考研] 0856 335分 +9 cccchenso 2026-03-29 9/450 2026-03-31 16:37 by lishahe
[考研] 一志愿大连理工大学材料求调剂 +6 Gymno 2026-03-30 6/300 2026-03-31 07:26 by 无际的草原
[考研] 抱歉 +4 田洪有 2026-03-30 4/200 2026-03-30 21:26 by mumin1990
[考研] 071010 323 分求调剂 +3 Baekzhy 2026-03-27 3/150 2026-03-30 14:24 by andresqi
[考研] 一志愿北京工业大学,324分求调剂 +6 零八# 2026-03-28 6/300 2026-03-29 21:20 by nanaliuyun
[考研] 本科新能源科学与工程,一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 一志愿上海理工能源动力(085800)310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 085602化学工程求调剂。 +4 平乐乐乐 2026-03-26 4/200 2026-03-26 17:57 by fmesaito
信息提示
请填处理意见