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建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊?送金币
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molly20123832
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散金: 4
帖子: 17
在线: 7.2小时
虫号: 1018287
注册: 2010-05-14
专业: 环境微生物学
[
求助
]
建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊?送金币
已有2人参与
我在建系统发育树时,先是在ncbi上通过blast找到相似度在96%-99%的序列,然后编辑好后用bioedit切头切尾,再用mega4进行建树,用的是NJ法,可是为什么建好的树置信度那么低呢,有些只有30多?还有就是写文章时用的图是original tree 还是bootstrap consensus tree?求高人指点~不要说写理论的(像我在百度搜了好多次都是摆一大堆道理,没实际指导),图下
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1楼
2011-09-14 14:19:53
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beabeer
新虫
(初入文坛)
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金币: 12
帖子: 2
在线: 2.1小时
虫号: 3286684
注册: 2014-06-22
专业: 生物信息学
我用的MEGA5 开始也出现这种情况,后来调整options summary的数据就好了,你可以将里面的挨个试一下~
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32楼
2014-06-22 10:38:56
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