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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 关于酵母的鉴定
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慧之兰溪

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于酵母的鉴定

P出了酵母的26S D1/D2区，测序鉴定，然后BLAST，向各位请教，NCBI上的那几个指标，哪一个可以作为判别种属的标准啊，Max Score、Query Coverage、E Value、还是Max Ident？
我截了个图，大家帮我分析分析~~~O(∩_∩)O谢谢。
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1楼 2011-09-13 09:56:21
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慧之兰溪

铁虫 (小有名气)
从BLAST结果上看，到底是哪个同源性最高呢？
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2楼2011-09-13 09:58:43
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muscle920

禁虫 (小有名气)
慧之兰溪(金币+4): 2012-02-28 10:12:05
本帖内容被屏蔽
3楼2011-10-07 23:35:46
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yanweiivy

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

一般看，max identi
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4楼2011-10-08 15:27:30
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

Max Score、Query Coverage，Max Ident这几个值代表的含义是一样的，三者总体的趋势是一样的，理论上代表序列的相似度。
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风雪夜归人
5楼2011-10-08 16:56:40
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biogenro

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

内容已删除
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6楼2011-10-11 16:06:33
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鱼成双

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
主要参照total score，它是综合后面几项指标的总值、这里面Query Coverage表示的是序列长度的符合值、Max Ident是序列相似度值
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7楼2012-01-30 11:34:29
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zdwxxw

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个问题其实不用问，为什么数据库中的排列要这样排呢？你看看哪一项数据是按照从大到小的顺序排列的就好了。。。
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踏踏实实做好自己，其他的事与你无关。
8楼2012-02-13 19:47:37
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