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慧之兰溪

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于酵母的鉴定

P出了酵母的26S D1/D2区,测序鉴定,然后BLAST,向各位请教,NCBI上的那几个指标,哪一个可以作为判别种属的标准啊,Max Score、Query Coverage、E Value、还是Max Ident?
我截了个图,大家帮我分析分析~~~O(∩_∩)O谢谢。
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慧之兰溪

铁虫 (小有名气)

从BLAST结果上看,到底是哪个同源性最高呢?
2楼2011-09-13 09:58:43
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muscle920

禁虫 (小有名气)

慧之兰溪(金币+4): 2012-02-28 10:12:05
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3楼2011-10-07 23:35:46
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yanweiivy

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

一般看,max identi
4楼2011-10-08 15:27:30
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

Max Score、Query Coverage,Max Ident这几个值代表的含义是一样的,三者总体的趋势是一样的,理论上代表序列的相似度。
风雪夜归人
5楼2011-10-08 16:56:40
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biogenro

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

内容已删除
6楼2011-10-11 16:06:33
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鱼成双

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
主要参照total score,它是综合后面几项指标的总值、这里面Query Coverage表示的是序列长度的符合值、Max Ident是序列相似度值
7楼2012-01-30 11:34:29
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zdwxxw

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个问题其实不用问,为什么数据库中的排列要这样排呢?你看看哪一项数据是按照从大到小的顺序排列的就好了。。。
踏踏实实做好自己,其他的事与你无关。
8楼2012-02-13 19:47:37
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