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northern杂交和southern杂交的区别
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yicao917
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[交流]
northern杂交和southern杂交的区别
请问northern杂交和southern杂交使用范围上有事么区别,既然DNA更稳定为什么不都用DNA来杂交呢?
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1楼
2011-09-08 22:42:22
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wanhscn
木虫
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dhd997(金币+1): bucuo 2011-09-11 09:03:21
引用回帖:
6楼
:
Originally posted by
yicao917
at 2011-09-09 23:11:51:
可是现在有很多构建全长cDNA的方法啊,我见一个师姐用体外转录RNA作为探针,我想要这么麻烦的话不如直接用DNA好了,毕竟DNA比较方便
体外转录的RNA没有内含子,基因组DNA有内含子,他是基于这个方面的考虑
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7楼
2011-09-10 00:08:20
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wanhscn
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yicao917(金币
+1
):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-09-09 07:47:24
Northern blot 可用来检测特定基因的表达丰度、样式,还可用来检测目的基因是否具有可变剪切产物或者重复序列等;Southern blot 较容易,一般用于基因拷贝数分析,指纹图谱、早期分子标记等
你的意思是将 RNA 反转录成cDNA后在转到膜上。这个恐怕不行,因为在我研究的这个物种中,有的RNA反转录得不到cDNA全长,这个自然不行。
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2楼
2011-09-08 23:51:58
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cdl007
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):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-09-09 07:47:33
楼主的意思是为啥用northern,不用southern,不是转成cDNA。。
northern是检测的样品中RNA的量,这些RNA是基因组DNA的一个子集,因为有的基因你southern检测到,但它不表达,没有mRNA的条带。你有的基因拷贝数多,但是mRNA表达量少。northern检测你现在样品里有什么基因在高表达,这是southern做不到的
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3楼
2011-09-09 06:17:14
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taigongzaici
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yicao917(金币
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wanhscn(金币+1): 鼓励回帖交流! 2011-09-09 16:04:23
Northern印迹杂交(Northern blot)。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。
Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量[1][2]。
简言之,一个RNA;一个DNA
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5楼
2011-09-09 14:50:09
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