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yicao917

木虫 (小有名气)


[交流] northern杂交和southern杂交的区别

请问northern杂交和southern杂交使用范围上有事么区别,既然DNA更稳定为什么不都用DNA来杂交呢?
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cdl007

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-09-09 07:47:33
楼主的意思是为啥用northern,不用southern,不是转成cDNA。。

northern是检测的样品中RNA的量,这些RNA是基因组DNA的一个子集,因为有的基因你southern检测到,但它不表达,没有mRNA的条带。你有的基因拷贝数多,但是mRNA表达量少。northern检测你现在样品里有什么基因在高表达,这是southern做不到的
3楼2011-09-09 06:17:14
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taigongzaici

新虫 (小有名气)


★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
wanhscn(金币+1): 鼓励回帖交流! 2011-09-09 16:04:23
Northern印迹杂交(Northern blot)。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。

Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量[1][2]。
简言之,一个RNA;一个DNA
5楼2011-09-09 14:50:09
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dhd997(金币+1): bucuo 2011-09-11 09:03:21
引用回帖:
6楼: Originally posted by yicao917 at 2011-09-09 23:11:51:
可是现在有很多构建全长cDNA的方法啊,我见一个师姐用体外转录RNA作为探针,我想要这么麻烦的话不如直接用DNA好了,毕竟DNA比较方便

体外转录的RNA没有内含子,基因组DNA有内含子,他是基于这个方面的考虑
7楼2011-09-10 00:08:20
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冰淇淋飞呀

银虫 (小有名气)


★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
wanhscn(金币+2): 鼓励多多回帖! 2011-09-11 08:29:25
southern杂交是souther发明的方法,DNA断裂成单链后,进行DNA-DNA杂交。northern杂交是将RNA分子在变性琼脂糖凝胶中相互分离后,将RNA转移至硝酸纤维素滤膜上,用放射性标记的探针进行DNA-RNA杂交,此法是研究RNA(特别是mRNA)的主要方法之一,可测量RNA的含量和大小。
8楼2011-09-10 23:37:46
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普通回帖
★ ★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-09-09 07:47:24
Northern blot 可用来检测特定基因的表达丰度、样式,还可用来检测目的基因是否具有可变剪切产物或者重复序列等;Southern blot 较容易,一般用于基因拷贝数分析,指纹图谱、早期分子标记等

你的意思是将 RNA 反转录成cDNA后在转到膜上。这个恐怕不行,因为在我研究的这个物种中,有的RNA反转录得不到cDNA全长,这个自然不行。
2楼2011-09-08 23:51:58
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wscookie

新虫 (初入文坛)



yicao917(金币+1):谢谢参与
学习学习
4楼2011-09-09 13:46:14
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yicao917

木虫 (小有名气)



wanhscn(金币+1): 鼓励反馈。 2011-09-10 00:11:13
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-08 23:51:58:
Northern blot 可用来检测特定基因的表达丰度、样式,还可用来检测目的基因是否具有可变剪切产物或者重复序列等;Southern blot 较容易,一般用于基因拷贝数分析,指纹图谱、早期分子标记等

你的意思是将 RNA  ...

可是现在有很多构建全长cDNA的方法啊,我见一个师姐用体外转录RNA作为探针,我想要这么麻烦的话不如直接用DNA好了,毕竟DNA比较方便
6楼2011-09-09 23:11:51
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messi-lifeng

新虫 (小有名气)



yicao917(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
1265607楼: Originally posted by taigongzaici at 2011-09-09 14:50:09:
Northern印迹杂交(Northern blot)。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂 ...

Northern印迹杂交(Northern blot)。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。

Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量[1][2]。
简言之,一个RNA;一个DNA
9楼2012-04-17 08:46:55
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messi-lifeng

新虫 (小有名气)


Northern印迹杂交(Northern blot)。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建,称为Southern印迹技术,RNA印迹技术正好与DNA相对应,故被称为Northern印迹杂交,与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。

Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量[1][2]。
简言之,一个RNA;一个DNA
10楼2012-04-17 08:50:02
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970620866

新虫 (初入文坛)



yicao917(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
7楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-10 00:08:20
体外转录的RNA没有内含子,基因组DNA有内含子,他是基于这个方面的考虑...

那可以直接用western,就可以知道表达量了
11楼2018-12-06 19:59:24
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970620866

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
3楼: Originally posted by cdl007 at 2011-09-09 06:17:14
楼主的意思是为啥用northern,不用southern,不是转成cDNA。。

northern是检测的样品中RNA的量,这些RNA是基因组DNA的一个子集,因为有的基因你southern检测到,但它不表达,没有mRNA的条带。你有的基因拷贝数多 ...

用western就可以直接看到表达量了呀
12楼2018-12-06 20:08:03
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