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yicao917

木虫 (小有名气)

[交流] northern杂交和southern杂交的区别

请问northern杂交和southern杂交使用范围上有事么区别，既然DNA更稳定为什么不都用DNA来杂交呢？
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1楼 2011-09-08 22:42:22
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

cdl007

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-09-09 07:47:33
楼主的意思是为啥用northern，不用southern，不是转成cDNA。。

northern是检测的样品中RNA的量，这些RNA是基因组DNA的一个子集，因为有的基因你southern检测到，但它不表达，没有mRNA的条带。你有的基因拷贝数多，但是mRNA表达量少。northern检测你现在样品里有什么基因在高表达，这是southern做不到的
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3楼2011-09-09 06:17:14
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taigongzaici

新虫 (小有名气)
★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
wanhscn(金币+1): 鼓励回帖交流！ 2011-09-09 16:04:23
Northern印迹杂交（Northern blot）。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建，称为Southern印迹技术，RNA印迹技术正好与DNA相对应，故被称为Northern印迹杂交，与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。

Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段，将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上，经干烤或者紫外线照射固定，再与相对应结构的标记探针进行杂交，用放射自显影或酶反应显色，从而检测特定DNA分子的含量[1][2]。
简言之，一个ＲＮＡ；一个DNA
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5楼2011-09-09 14:50:09
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★
dhd997(金币+1): bucuo 2011-09-11 09:03:21
引用回帖:
6楼: Originally posted by yicao917 at 2011-09-09 23:11:51:
可是现在有很多构建全长cDNA的方法啊，我见一个师姐用体外转录RNA作为探针，我想要这么麻烦的话不如直接用DNA好了，毕竟DNA比较方便

体外转录的RNA没有内含子，基因组DNA有内含子，他是基于这个方面的考虑
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7楼2011-09-10 00:08:20
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冰淇淋飞呀

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
wanhscn(金币+2): 鼓励多多回帖！ 2011-09-11 08:29:25
southern杂交是souther发明的方法，DNA断裂成单链后，进行DNA-DNA杂交。northern杂交是将RNA分子在变性琼脂糖凝胶中相互分离后，将RNA转移至硝酸纤维素滤膜上，用放射性标记的探针进行DNA-RNA杂交，此法是研究RNA(特别是mRNA)的主要方法之一，可测量RNA的含量和大小。
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8楼2011-09-10 23:37:46
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普通回帖

wanhscn

木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
yicao917(金币+1):谢谢参与
dhd997(金币+3): good 2011-09-09 07:47:24
Northern blot 可用来检测特定基因的表达丰度、样式，还可用来检测目的基因是否具有可变剪切产物或者重复序列等；Southern blot 较容易，一般用于基因拷贝数分析，指纹图谱、早期分子标记等

你的意思是将 RNA 反转录成cDNA后在转到膜上。这个恐怕不行，因为在我研究的这个物种中，有的RNA反转录得不到cDNA全长，这个自然不行。
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2楼2011-09-08 23:51:58
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wscookie

新虫 (初入文坛)
★
yicao917(金币+1):谢谢参与
????
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4楼2011-09-09 13:46:14
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yicao917

木虫 (小有名气)
★
wanhscn(金币+1): 鼓励反馈。 2011-09-10 00:11:13
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-08 23:51:58:
Northern blot 可用来检测特定基因的表达丰度、样式，还可用来检测目的基因是否具有可变剪切产物或者重复序列等；Southern blot 较容易，一般用于基因拷贝数分析，指纹图谱、早期分子标记等

你的意思是将 RNA  ...

可是现在有很多构建全长cDNA的方法啊，我见一个师姐用体外转录RNA作为探针，我想要这么麻烦的话不如直接用DNA好了，毕竟DNA比较方便
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6楼2011-09-09 23:11:51
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messi-lifeng

新虫 (小有名气)
★
yicao917(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
1265607楼: Originally posted by taigongzaici at 2011-09-09 14:50:09:
Northern印迹杂交（Northern blot）。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建，称为Southern印迹技术，RNA印迹技术正好与DNA相对应，故被称为Northern印迹杂 ...

Northern印迹杂交（Northern blot）。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建，称为Southern印迹技术，RNA印迹技术正好与DNA相对应，故被称为Northern印迹杂交，与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。

Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段，将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上，经干烤或者紫外线照射固定，再与相对应结构的标记探针进行杂交，用放射自显影或酶反应显色，从而检测特定DNA分子的含量[1][2]。
简言之，一个ＲＮＡ；一个DNA
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9楼2012-04-17 08:46:55
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messi-lifeng

新虫 (小有名气)
Northern印迹杂交（Northern blot）。这是一种将RNA从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。DNA印迹技术由Southern于1975年创建，称为Southern印迹技术，RNA印迹技术正好与DNA相对应，故被称为Northern印迹杂交，与此原理相似的蛋白质印迹技术则被称为Western blot。

Southern印迹杂交是进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段，将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上，经干烤或者紫外线照射固定，再与相对应结构的标记探针进行杂交，用放射自显影或酶反应显色，从而检测特定DNA分子的含量[1][2]。
简言之，一个ＲＮＡ；一个DNA
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10楼2012-04-17 08:50:02
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970620866

新虫 (初入文坛)
★
yicao917(金币+1): 谢谢参与
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7楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-10 00:08:20
体外转录的RNA没有内含子，基因组DNA有内含子，他是基于这个方面的考虑...

那可以直接用western，就可以知道表达量了
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11楼2018-12-06 19:59:24
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970620866

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cdl007 at 2011-09-09 06:17:14
楼主的意思是为啥用northern，不用southern，不是转成cDNA。。

northern是检测的样品中RNA的量，这些RNA是基因组DNA的一个子集，因为有的基因你southern检测到，但它不表达，没有mRNA的条带。你有的基因拷贝数多 ...

用western就可以直接看到表达量了呀
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12楼2018-12-06 20:08:03
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