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铜虫 (初入文坛)

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[求助] 基因注释证据整合软件

不知道基因注释用什么整合软件比较好。glean除外。谢谢了！！！！！！！！！

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1楼2011-09-07 15:15:02

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yangsh_nj

木虫 (著名写手)

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专业: 运动生理学

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-09-07 18:10:50

不知道你所需要的gene annotation指的到底是什么。基因组或获得片段基因的预测？这个用FgeneSH (www.softberry.com)还不错，至少比genescan什么的要靠谱些。如果是已知基因片段，想知道类似基因的功能，可采用blast的方法去搜索已知功能基因的annotation。也可以通过GO分析大致知道其基本生物学分类，或pfam知道其已知的结构域，然后做一定的功能推测。