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hbfxxj

铜虫 (初入文坛)

[求助] 基因注释证据整合软件

不知道基因注释用什么整合软件比较好。glean除外。谢谢了!!!!!!!!!
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yangsh_nj

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流。 2011-09-07 18:10:50
不知道你所需要的gene annotation指的到底是什么。基因组或获得片段基因的预测?这个用FgeneSH (www.softberry.com)还不错,至少比genescan什么的要靠谱些。如果是已知基因片段,想知道类似基因的功能,可采用blast的方法去搜索已知功能基因的annotation。也可以通过GO分析大致知道其基本生物学分类,或pfam知道其已知的结构域,然后做一定的功能推测。
2楼2011-09-07 15:35:31
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hbfxxj

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by hbfxxj at 2011-09-07 15:15:02:
不知道基因注释用什么整合软件比较好。glean除外。谢谢了!!!!!!!!!

就是看有没有和glean这个软件功能相似的软件。
3楼2011-09-07 17:37:26
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hbfxxj

铜虫 (初入文坛)

内容已删除
4楼2011-09-07 17:43:19
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