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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体软件 » 根据platon软件编辑CIF中氢键表中，出问题，请教
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独孤雪

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 根据platon软件编辑CIF中氢键表中，出问题，请教

CIF文件末尾加入氢键信息显示
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
C7 H7 O3 0.95 2.58 3.44   152
结果check出错
Warning: loop imbalance (go to loop)
_geom_hbond_publ_flag = DUMMY not a permitted value (no, n, yes, y)
(go to loop)
求解，非常谢谢
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1楼 2011-09-06 00:08:03
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
lichun1210(金币+1): 欢迎常来晶体版交流！ 2011-09-06 09:15:44
CIF中的氢键是精修得到的，而不是人为添加的。
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2楼2011-09-06 09:08:49
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独孤雪

铁杆木虫 (著名写手)
用什么软件精修啊，不懂啊，跪求
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3楼2011-09-06 09:10:16
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
lichun1210(金币+1): 谢谢参与 2011-09-06 12:15:23
[交流]根据platon软件编辑CIF中氢键表中，出问题，请教

CIF文件末尾加入氢键信息显示
loop_
_geom_hbond_atom_site_label_D
_geom_hbond_atom_site_label_H
_geom_hbond_atom_site_label_A
_geom_hbond_distance_DH
_geom_hbond_distance_HA
_geom_hbond_distance_DA
_geom_hbond_angle_DHA
_geom_hbond_site_symmetry_A
_geom_hbond_publ_flag
C7 H7 O3 0.95 2.58 3.44   152 .
152后面空一格，加个点"."试试看
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4楼2011-09-06 12:00:06
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
lichun1210(金币+2): 感谢老师回帖交流！ 2011-09-06 12:15:46
参见拙贴

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=962939
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5楼2011-09-06 12:02:54
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独孤雪

铁杆木虫 (著名写手)
加点不行的
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6楼2011-09-06 16:28:12
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独孤雪

铁杆木虫 (著名写手)
不晓得，似乎其他问题
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7楼2011-09-06 16:31:26
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
把这一行去掉试试“_geom_hbond_publ_flag”
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8楼2011-09-06 16:47:17
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独孤雪

铁杆木虫 (著名写手)
也不行
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9楼2011-09-06 19:14:41
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独孤雪

铁杆木虫 (著名写手)
反而显示A类错误
Alert level A
PLAT726_ALERT_2_A H...A   Calc     6.51000, Rep     2.58000 Dev...       3.93 Ang.
              H7   -O3      1.555   1.555                    #        123      
PLAT727_ALERT_1_A D...A   Calc    6.134(7), Rep     3.44000 Dev...       2.69 Ang.
              C7   -O3      1.555   1.555                    #        123      
PLAT728_ALERT_1_A D-H..A  Calc       63.00, Rep      152.00 Dev...      89.00 Deg.
              C7   -H7   -O3      1.555   1.555   1.555      #        207
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10楼2011-09-06 23:29:05
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