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微星主板

新虫 (小有名气)

[求助] 想进行某个基因的mRNA含量测定,但是这个基因的mRNA有分型

想进行某个基因的mRNA含量测定,但是这个基因的mRNA有分型。想问问引物设计怎么处理。mRNA测定用荧光RT-PCR.最好具体一点,比如含有不同外含子的几个mRNA怎么不对等等。请各位高手帮忙啦!
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做个幸福的人
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微星主板

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cdl007 at 2011-09-02 18:48:09:
可以,
不过不用对比,NCBI上标注的清楚,仔细读读,找到序列拷贝下来就行

谢谢提醒,我再仔细看看
做个幸福的人
7楼2011-09-04 13:28:17
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查看全部 7 个回答

cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): 2011-09-02 06:54:53
微星主板(金币+2): 说的对啊 2011-09-02 09:56:19
有分型的话,一般是选最长的那条来设计,或者 是设计在几个分型都有的共同区域,
忌讳设计在不同外显子之间,要么P不到,要么P的也许是微小含量的成分
4楼2011-09-02 06:45:07
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微星主板

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cdl007 at 2011-09-02 06:45:07:
有分型的话,一般是选最长的那条来设计,或者 是设计在几个分型都有的共同区域,
忌讳设计在不同外显子之间,要么P不到,要么P的也许是微小含量的成分

谢谢 那么我用软件将几个分型mRNA进行对比,然后将引物设计在共同区域就可以吧?
做个幸福的人
5楼2011-09-02 09:58:24
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cdl007

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
西瓜(金币+2): Good! 2011-09-02 18:57:57
dhd997(金币+2): good 2011-09-03 07:48:14
可以,
不过不用对比,NCBI上标注的清楚,仔细读读,找到序列拷贝下来就行
6楼2011-09-02 18:48:09
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