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jj2006

木虫 (小有名气)

[求助] amber中硅原子键参数如何获取?

用amber做动力学计算涉及到了硅烷化试剂分子,但是amber力场里面好像没有对应的硅原子的力学参数,怎样才能获取相应的力学参数,求高手指教!!!

[ Last edited by jj2006 on 2011-8-28 at 15:58 ]
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it‘snottimetomakeadecision,it'stimetomakemistakes!
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jj2006

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by dubo at 2011-08-29 22:52:32:
http://davapc1.bioch.dundee.ac.uk/prodrg/

这有手册

可惜里面暂时无法识别SI
it‘snottimetomakeadecision,it'stimetomakemistakes!
4楼2011-08-30 12:53:05
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jj2006

木虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by shengxiang at 2011-09-21 10:11:53:
amber里就是没有Si的,还是想想用别的力场吧

别的立场可以和amber兼容吗?立场参数在哪里找?我搜了很多文献,收获很少啊......
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7楼2011-09-21 21:48:46
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