应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 旋光值计算结果分析
51/1返回列表
查看: 3933  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

[求助] 旋光值计算结果分析

本人在波长589nm下计算旋光，但是结果和实验值有点差距，可能是计算值和实验值的单位和浓度不一样，我想问问计算值给出的结果是比旋光度吗？如何得来的，

w=    0.000000 a.u., Optical Rotation Beta=     -0.2141 au.
Molar Mass =    308.3304 grams/mole, [Alpha]D =      -26.84 deg.
G' tensor for W=    0.077357:
  7.37664212-15.65843256 -9.02937206
26.58281053 -6.75150182 -7.26231548
  0.61589955  1.31519761  0.17403044
w=    0.077357 a.u., Optical Rotation Beta=     -0.2664 au.
Molar Mass =    308.3304 grams/mole, [Alpha] ( 5890.0 A) =      -33.43 deg.
G*W tensor for W=    0.077357:

实验值是-13
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

经验

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
我们在为了文章而搞科研
1楼 2011-08-28 11:48:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫
引用回帖:
3楼: Originally posted by libugou at 2013-12-03 23:26:04
本虫是一个gaussian盲，现正尝试计算手性分子的“旋光度”，可是用Gaussian提交了好几次，结果都是计算自动中止。现看到“旋光值计算结果分析 ”，故请问虫友kekexiliwolf，能否较详细的说明一下计算旋光度时，如何 ...

polar=optrot cphf=rdfreq b3lyp/6-31g(d) scrf=(pcm,solvent=methanol)  #计算方法
计算文件最后空一行输入频率，常用的钠灯是0.077357，别的自己换算，然后再空两行就可以了
赞一下(1人) 回复此楼
我们在为了文章而搞科研
4楼2013-12-04 08:43:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

gougaozhan

至尊木虫 (职业作家)

busy

【答案】应助回帖

kekexiliwolf(金币+3): 非常感谢，受益匪浅 2011-08-29 08:09:40
引用回帖:
1楼: Originally posted by kekexiliwolf at 2011-08-28 11:48:03:
本人在波长589nm下计算旋光，但是结果和实验值有点差距，可能是计算值和实验值的单位和浓度不一样，我想问问计算值给出的结果是比旋光度吗？如何得来的，

w=    0.000000 a.u., Optical Rotation Beta=     -0 ...

可见计算得到的是-33那个，589nm。这差别不算大，最主要的是符号要相同。因为在实验中一是溶剂，二是温度等等条件，而计算是在气相。肯定会由影响。另外计算所用基组方法的那个也会由影响。还有就是实验也没有标出ee值。

参见如下：
第一，由于采用的基组不是完备基组，计算精度不够高，第二，计算的假定条件为气相孤立分子，气相孤立分子的分子间距较大，而实验测定则在溶液中，分子间距较近，此外，计算的旋光度仅是最稳定构象体的，还有一些亚稳定的构象体，原则上需要采用波子曼分布来求各种可能构象体的旋光度贡献总和。第三，在实验上测定旋光度时，没有指出过量对映异构体的（ee，Excess Enantiomer）含量，也没有指出光学异构体之间能否相互转化。如果样品含有一定量的外消旋体，测定的旋光度定然会偏小。
赞一下 回复此楼
^_^不要生气||要争气，不要看破||要突破，不要嫉妒||要欣赏，不要托延||要积极，不要心动||要行动^_^
2楼2011-08-28 21:11:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

libugou

金虫 (正式写手)
本虫是一个gaussian盲，现正尝试计算手性分子的“旋光度”，可是用Gaussian提交了好几次，结果都是计算自动中止。现看到“旋光值计算结果分析 ”，故请问虫友kekexiliwolf，能否较详细的说明一下计算旋光度时，如何提交高斯的命令。非常感谢！
赞一下 回复此楼
3楼2013-12-03 23:26:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

libugou

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by kekexiliwolf at 2013-12-04 08:43:59
polar=optrot cphf=rdfreq b3lyp/6-31g(d) scrf=(pcm,solvent=methanol)  #计算方法
计算文件最后空一行输入频率，常用的钠灯是0.077357，别的自己换算，然后再空两行就可以了...

非常感谢楼主kekexiliwolf及时的回复！
我对用Gaussian程序直接提交工作任务很不熟悉，因此想继续问您几个用GaussianView提交工作任务的几个问题：
1.是不是计算ECD(电子圆二色谱)和ORD(旋光度或比旋光度)时， “Job tye”选项的下拉菜单中，都必须选“Frequency”?
2. Gaussian中文手册关于“Freq”计算中有一句话：“推荐的方法是在前一个几何优化的结构上，使用同样的方法进行频率计算。”我们在做结构优化时，“Method“第一个选项的下拉菜单中，选择的是“Ground State”。我想问：在计算ECD和ORD时，是否必须选“Ground State”，还是也可以选“TD-SCF”?
3. 在计算ORD时，在“additional keywords”中输入“Polar=OptRot，cphf=rdfreq ”，还是只输入“Polar=OptRot”就可以了？
4. 如果只想计算589nm波长下的ORD，如何在additional keywords输入相关的数值？是输入5890.0（您的计算结果中以A（埃）为单位的数值），还是输入0.077357（您提到的“常用的钠灯是0.077357”的数值）？
5.您提到的“常用的钠灯是0.077357”的数值，请问能否告知这个数值和589nm这个值之间的转换关系？
6. 读过“Gaussian中文手册”，“Exploring Chemistry with Electronic Structure Method”，还有郭勇的“高斯使用指南”，这些书中关于如何计算ECD和ORD的内容非常少，不知道楼主能否分享一些这方面计算的资料？或者给点建议也行？

本人知识浅薄，问题有点多，可能还非常肤浅，但是求助无门，只能向楼主求救了！
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-04 14:48:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭