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kekexiliwolf金虫 (正式写手)
小屁虫
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[求助]
旋光值计算结果分析
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本人在波长589nm下计算旋光，但是结果和实验值有点差距，可能是计算值和实验值的单位和浓度不一样，我想问问计算值给出的结果是比旋光度吗？如何得来的， w= 0.000000 a.u., Optical Rotation Beta= -0.2141 au. Molar Mass = 308.3304 grams/mole, [Alpha]D = -26.84 deg. G' tensor for W= 0.077357: 7.37664212-15.65843256 -9.02937206 26.58281053 -6.75150182 -7.26231548 0.61589955 1.31519761 0.17403044 w= 0.077357 a.u., Optical Rotation Beta= -0.2664 au. Molar Mass = 308.3304 grams/mole, [Alpha] ( 5890.0 A) = -33.43 deg. G*W tensor for W= 0.077357: 实验值是-13 |
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【答案】应助回帖
kekexiliwolf(金币+3): 非常感谢，受益匪浅 2011-08-29 08:09:40
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可见计算得到的是-33那个，589nm。这差别不算大，最主要的是符号要相同。因为在实验中一是溶剂，二是温度等等条件，而计算是在气相。肯定会由影响。另外计算所用基组方法的那个也会由影响。还有就是实验也没有标出ee值。 参见如下： 第一，由于采用的基组不是完备基组，计算精度不够高，第二，计算的假定条件为气相孤立分子，气相孤立分子的分子间距较大，而实验测定则在溶液中，分子间距较近，此外，计算的旋光度仅是最稳定构象体的，还有一些亚稳定的构象体，原则上需要采用波子曼分布来求各种可能构象体的旋光度贡献总和。第三，在实验上测定旋光度时，没有指出过量对映异构体的（ee，Excess Enantiomer）含量，也没有指出光学异构体之间能否相互转化。如果样品含有一定量的外消旋体，测定的旋光度定然会偏小。 |
2楼2011-08-28 21:11:50
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3楼2013-12-03 23:26:04
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4楼2013-12-04 08:43:59
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非常感谢楼主kekexiliwolf及时的回复！ 我对用Gaussian程序直接提交工作任务很不熟悉，因此想继续问您几个用GaussianView提交工作任务的几个问题： 1.是不是计算ECD(电子圆二色谱)和ORD(旋光度或比旋光度)时， “Job tye”选项的下拉菜单中，都必须选“Frequency”? 2. Gaussian中文手册关于“Freq”计算中有一句话：“推荐的方法是在前一个几何优化的结构上，使用同样的方法进行频率计算。”我们在做结构优化时，“Method“第一个选项的下拉菜单中，选择的是“Ground State”。我想问：在计算ECD和ORD时，是否必须选“Ground State”，还是也可以选“TD-SCF”? 3. 在计算ORD时，在“additional keywords”中输入“Polar=OptRot，cphf=rdfreq ”，还是只输入“Polar=OptRot”就可以了？ 4. 如果只想计算589nm波长下的ORD，如何在additional keywords输入相关的数值？是输入5890.0（您的计算结果中以A（埃）为单位的数值），还是输入0.077357（您提到的“常用的钠灯是0.077357”的数值）？ 5.您提到的“常用的钠灯是0.077357”的数值，请问能否告知这个数值和589nm这个值之间的转换关系？ 6. 读过“Gaussian中文手册”，“Exploring Chemistry with Electronic Structure Method”，还有郭勇的“高斯使用指南”，这些书中关于如何计算ECD和ORD的内容非常少，不知道楼主能否分享一些这方面计算的资料？或者给点建议也行？ 本人知识浅薄，问题有点多，可能还非常肤浅，但是求助无门，只能向楼主求救了！ |
5楼2013-12-04 14:48:38
daiyang
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帮回答： 1、不是 2、分情况 3、前者 4、5、这是原子单位，请查相关资料 6、ECD、ORD本人不是很熟，但高斯入门后凭网上能搜到的资料很快上手是没问题的 重复一个建议： 输入文件中，除了分子结构用GV来画，其它部分都自己手写，不然如依靠GV或网友模板，永远都是未入门的水平。 如果觉得自己没必要学这些东西，那就干脆一点都不学，计算全部外包出去，合作也好出钱也好，这样自己和帮你的人都省心。 不是批评您，你的学习态度还是非常好的，但至少包括本人在内的大部分网友已经没有动力重复“Exploring Chemistry with Electronic Structure Method”以及高斯说明书上的内容了，你需要的是身边一个权威性的、随时能告诉你翻哪本书哪几页的师兄/师姐  |
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