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wqj1988926金虫 (正式写手)
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[求助]
我自己利用四个软件做的系谱树图，我应该相信那个软件
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我自己利用四个软件做的系谱树图，所用的序列是一样的，结果不一样，我应该相信那个软件？ 从上到下依次是我分别采用megalign、mega，phylogeny、clustalw做的图，各位大侠给个意见。     |
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cexoihtydx
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amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-08-27 16:58:26
wqj1988926(金币+1): 2011-08-28 16:59:38
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wqj1988926(金币+1): 2011-08-28 16:59:38
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mega 参考文献： 1 MEGA: Molecular Evolutionary Genetics Analysis software for microcomputers 2 MEGA: a biologist-centric software for evolutionary analysis of DNA and protein sequences 3 MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0 |
7楼2011-08-27 14:28:25
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3楼2011-08-26 21:43:53
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4楼2011-08-27 08:33:25
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amisking(金币+3, BioEPI+1): 鼓励个！ 2011-08-27 16:58:18
wqj1988926(金币+2): 2011-08-28 16:59:21
amisking(金币+3, BioEPI+1): 鼓励个！ 2011-08-27 16:58:18
wqj1988926(金币+2): 2011-08-28 16:59:21
| 个人认为可以使用meta构建进化树（论文参考文献中引用），你可以参考相关文献中使用mega构建的进化树是怎么论述的，一般是把你得到的基因序列和已知基因序列（文献中报道的）一起构建进化树，从而比较你的基因与这些已知基因的进化关系；同时，如果你也可以通过阅读文献，查阅已知基因序列中有无一些最保守的氨基酸位点（催化位点、结合位点等等），在你的基因中是否也同样存在，如果存在也能证明你的基因的特征。上一步可以生成氨基酸多序列比对的图，并用*号标出这些特征性氨基酸。这样便可获得两组数据：构建的进化树和氨基酸多序列比对，即形成论文中的两个Figure。 |
5楼2011-08-27 14:19:06
