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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 我自己利用四个软件做的系谱树图，我应该相信那个软件
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

[求助] 我自己利用四个软件做的系谱树图，我应该相信那个软件

我自己利用四个软件做的系谱树图，所用的序列是一样的，结果不一样，我应该相信那个软件？
从上到下依次是我分别采用megalign、mega，phylogeny、clustalw做的图，各位大侠给个意见。
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风雪夜归人
1楼 2011-08-26 19:43:03
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cexoihtydx at 2011-08-26 21:43:53:
mega比clusterw好

能具体说说好在哪嘛，我第一次接触这些软件，
还有就是，我的这些图可以放到文章中区码，如果不能还缺些啥，（我知道后面的名称需要修改）
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风雪夜归人
4楼2011-08-27 08:33:25
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
lstt09nk(金币+1): 感谢参与 2011-08-27 10:40:56
wqj1988926(金币+1): 2011-11-08 12:56:23
mega比clusterw好
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不放弃，日子总有阳光，追求总有希望！
3楼2011-08-26 21:43:53
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3, BioEPI+1): 鼓励个！ 2011-08-27 16:58:18
wqj1988926(金币+2): 2011-08-28 16:59:21
个人认为可以使用meta构建进化树（论文参考文献中引用），你可以参考相关文献中使用mega构建的进化树是怎么论述的，一般是把你得到的基因序列和已知基因序列（文献中报道的）一起构建进化树，从而比较你的基因与这些已知基因的进化关系；同时，如果你也可以通过阅读文献，查阅已知基因序列中有无一些最保守的氨基酸位点（催化位点、结合位点等等），在你的基因中是否也同样存在，如果存在也能证明你的基因的特征。上一步可以生成氨基酸多序列比对的图，并用*号标出这些特征性氨基酸。这样便可获得两组数据：构建的进化树和氨基酸多序列比对，即形成论文中的两个Figure。
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不放弃，日子总有阳光，追求总有希望！
5楼2011-08-27 14:19:06
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

wqj1988926(金币+6): 2011-11-08 12:56:47
是mega,不是meta,写错了。
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不放弃，日子总有阳光，追求总有希望！
6楼2011-08-27 14:20:40
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