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wqj1988926

金虫 (正式写手)

[求助] 我自己利用四个软件做的系谱树图,我应该相信那个软件

我自己利用四个软件做的系谱树图,所用的序列是一样的,结果不一样,我应该相信那个软件?
从上到下依次是我分别采用megalign、mega,phylogeny、clustalw做的图,各位大侠给个意见。






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风雪夜归人
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2楼2011-08-26 19:44:37
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
lstt09nk(金币+1): 感谢参与 2011-08-27 10:40:56
wqj1988926(金币+1): 2011-11-08 12:56:23
mega比clusterw好
不放弃,日子总有阳光,追求总有希望!
3楼2011-08-26 21:43:53
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by cexoihtydx at 2011-08-26 21:43:53:
mega比clusterw好

能具体说说好在哪嘛,我第一次接触这些软件,
还有就是,我的这些图可以放到文章中区码,如果不能还缺些啥,(我知道后面的名称需要修改)
风雪夜归人
4楼2011-08-27 08:33:25
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3, BioEPI+1): 鼓励个! 2011-08-27 16:58:18
wqj1988926(金币+2): 2011-08-28 16:59:21
个人认为可以使用meta构建进化树(论文参考文献中引用),你可以参考相关文献中使用mega构建的进化树是怎么论述的,一般是把你得到的基因序列和已知基因序列(文献中报道的)一起构建进化树,从而比较你的基因与这些已知基因的进化关系;同时,如果你也可以通过阅读文献,查阅已知基因序列中有无一些最保守的氨基酸位点(催化位点、结合位点等等),在你的基因中是否也同样存在,如果存在也能证明你的基因的特征。上一步可以生成氨基酸多序列比对的图,并用*号标出这些特征性氨基酸。这样便可获得两组数据:构建的进化树和氨基酸多序列比对,即形成论文中的两个Figure。
不放弃,日子总有阳光,追求总有希望!
5楼2011-08-27 14:19:06
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

wqj1988926(金币+6): 2011-11-08 12:56:47
是mega,不是meta,写错了。
不放弃,日子总有阳光,追求总有希望!
6楼2011-08-27 14:20:40
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cexoihtydx

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-08-27 16:58:26
wqj1988926(金币+1): 2011-08-28 16:59:38
mega 参考文献:
1 MEGA: Molecular Evolutionary Genetics Analysis software for microcomputers
2 MEGA: a biologist-centric software for evolutionary analysis of DNA and protein sequences
3 MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0
不放弃,日子总有阳光,追求总有希望!
7楼2011-08-27 14:28:25
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8楼2012-01-12 18:05:57
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顶一下,感谢分享!
9楼2014-09-18 16:32:43
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