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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 自己做的系谱树图
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

[交流] 自己做的系谱树图

这是小弟自己用MegAlign做的系谱树图，各位大侠指点小弟一下，有什么问题？
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1楼 2011-08-24 16:36:44
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
amisking(金币+2): 最近很活跃，奖励下。 2011-08-24 20:02:32
wqj1988926(金币+1): 2011-08-24 20:42:41
wqj1988926(金币+1): 2011-08-25 08:39:43
楼主的bootstrape能不能计算一下呢？
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4楼2011-08-24 19:39:58
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-24 19:39:58:
楼主的bootstrape能不能计算一下呢？

怎么计算呀，我是刚学的，设么都不太懂，能说清楚一点吗，谢谢。
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5楼2011-08-24 20:42:21
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
西瓜: 你的问题在哪里……你不说清楚，别人没法帮你啊。 2011-08-25 18:31:24
咋没有回复呢，自己顶下吧，不然给沉了》
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6楼2011-08-25 08:43:38
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wanhscn

木虫 (职业作家)
差不多能用
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7楼2011-08-25 09:18:03
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wanhscn

木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
wqj1988926(金币+2): 2011-08-25 19:01:32
但是序列的名字要以物种基因的正规命名为准
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8楼2011-08-25 09:19:45
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zcius

至尊木虫 (知名作家)
做得好！
学习了。
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9楼2011-08-25 09:27:18
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
西瓜(金币+3, MolEPI+1): 很活跃啊 2011-08-25 18:32:33
wqj1988926(金币+2): 2011-08-25 19:05:01
引用回帖:
5楼: Originally posted by wqj1988926 at 2011-08-24 20:42:21:
怎么计算呀，我是刚学的，设么都不太懂，能说清楚一点吗，谢谢。

楼主，我们用的是EML的PHYML，可以输入序列，blast 选定要比对的序列，做进化树，通过选项选择是否显示相关值，楼主可以试一下！http://www.phylogeny.fr/version2_cgi/one_task.cgi?task_type=blast
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10楼2011-08-25 11:32:25
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by wqj1988926 at 2011-08-25 08:43:38:
咋没有回复呢，自己顶下吧，不然给沉了》

我是第一次做的，也不知道存在什么问题，只是想问下，这张图能用在文章里吗？
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11楼2011-08-25 19:03:47
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by wanhscn at 2011-08-25 09:19:45:
但是序列的名字要以物种基因的正规命名为准

大侠自己做过吗？
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12楼2011-08-25 19:05:33
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-25 11:32:25:
楼主，我们用的是EML的PHYML，可以输入序列，blast 选定要比对的序列，做进化树，通过选项选择是否显示相关值，楼主可以试一下！http://www.phylogeny.fr/version2_cgi/one_task.cgi?task_type=blast

我分别用三种软件做的系谱树，大侠给看看吧，从上到下分别是采用megalign、mega，phylogeny做的系谱树，好像不太一样，我应该选哪张呀？
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14楼2011-08-25 20:38:17
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wqj1988926

金虫 (正式写手)
西瓜: 可以编辑下1楼，把图放上去，这样看到的人更多哦 2011-08-26 17:18:12
引用回帖:
10楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-25 11:32:25:
楼主，我们用的是EML的PHYML，可以输入序列，blast 选定要比对的序列，做进化树，通过选项选择是否显示相关值，楼主可以试一下！http://www.phylogeny.fr/version2_cgi/one_task.cgi?task_type=blast

我分别用三种软件做的系谱树，大侠给看看吧，从上到下分别是采用megalign、mega，phylogeny做的系谱树，好像不太一样，我应该选哪张呀？
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15楼2011-08-25 20:42:35
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
wqj1988926(金币+1): 2011-08-27 13:23:22
引用回帖:
15楼: Originally posted by wqj1988926 at 2011-08-25 20:42:35:
我分别用三种软件做的系谱树，大侠给看看吧，从上到下分别是采用megalign、mega，phylogeny做的系谱树，好像不太一样，我应该选哪张呀？

[eimg]b4/5c/1156883_13 ...

楼主可以参考一下本领域内已经发表的文章看一下！
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16楼2011-08-26 09:05:21
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jyy_2042楼
2011-08-24 16:37   回复  
松松一号3楼
2011-08-24 16:37   回复  
davidfrela13楼
2011-08-25 19:20   回复  
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