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金虫 (正式写手)

与国同庆

[求助] 请教De novo测序相关问题 如染色体推测基因组

请教De novo测序相关问题 如染色体推测基因组
各位大师：
   请教DE NOVO测序，未知物种怎么通过染色体数目推测基因组大小？转录组大小又通过基因组推测如何得来（占有的比例是多少)?如果正常的是二倍体，那么四倍体的基因组是简单*2还是其他算法？
谢谢
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1楼 2011-08-20 16:28:00
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w2boluo

金虫 (小有名气)
★
1949stone(金币+1): 鼓励 2011-08-20 20:01:46
去看看华大的生物信息教程吧，印象中里面有用kmer估算基因组大小的方法。
赞一下(1人) 回复此楼
How about the future？
2楼2011-08-20 16:39:57
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-08-21 09:14:52
引用回帖:
2楼: Originally posted by w2boluo at 2011-08-20 16:39:57:
去看看华大的生物信息教程吧，印象中里面有用kmer估算基因组大小的方法。

你说的是这个吧。楼主可以看看哦
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3376518&fpage=1
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-08-20 22:33:15
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77747759

金虫 (正式写手)

与国同庆
我知道是估算，比如人基因组 染色体都知道了，老鼠的就很容易推？这个怎么推呢
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4楼2011-08-20 23:28:41
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