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jhonsmith001

金虫 (小有名气)


[交流] 求助rmsd 和asl rmsd的区别

我在用desmond做完分子动力学后,计算rmsd,一个是Total RMSD to frame,这个比较容易,值在3左右平衡;
另一个是 ASL RMSD to frame ,我想计算几个氨基酸残基在动力学中得轨迹变化,可是计算的曲线,平衡在20左右,我对这个asl RMSD不太懂,希望大哥们指点一二。没找到怎么设置会在3以内呀。
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