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happywoheni

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于进化树

我的酶基因克隆出来了,只知道DNA序列,可以做进化树吗?用mega做,是输这个酶基因序列还是翻译后的蛋白序列,还是菌株的基因组啊?
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by happywoheni at 2011-08-14 18:04:14:
没做表达,基因也可以做进化树吗?可以写进文章吗?
基因翻译出来的蛋白质预测二级结构,能写进文章吗?

不做表达做的进化树更准确呢,一般都是以16S rDNA来做遗传分析的DNA,如前面说,翻译后的蛋白质序列是“截短”的。
蛋白质二级结构的话,得看你是做什么目的了,你是要验证什么呢?是基因的功能么?还只是简单的分析其进化程度?如果是基因功能,蛋白质二级结构是必须做的,如果只是分析进化程度,就没有必要了
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
7楼2011-08-15 09:46:54
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查看全部 8 个回答

xbl3688

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


happywoheni(金币+1): 2011-08-14 16:10:41
西瓜(金币+1): 欢迎交流 2011-08-14 18:32:45
是都可以做进化树的
生活的乐趣在于善于发现美,学会欣赏美
2楼2011-08-14 16:09:17
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happywoheni

铁虫 (小有名气)

我用的是酶的DNA序列,好像是Neighbor-Joining,它和用DNAMAN比对后的结果表达的意思一样吗?
我还不太明白进化树反映什么?同源性反映什么?哎,找个明白人问问就好了
3楼2011-08-14 16:12:34
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happywoheni

铁虫 (小有名气)

没做表达,基因也可以做进化树吗?可以写进文章吗?
基因翻译出来的蛋白质预测二级结构,能写进文章吗?
5楼2011-08-14 18:04:14
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