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happywoheni

铁虫 (小有名气)

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[求助] 关于进化树

我的酶基因克隆出来了，只知道DNA序列，可以做进化树吗？用mega做，是输这个酶基因序列还是翻译后的蛋白序列，还是菌株的基因组啊？

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1楼 2011-08-14 15:17:12

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416114799

至尊木虫 (知名作家)

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引用回帖:

5楼: Originally posted by happywoheni at 2011-08-14 18:04:14:
没做表达，基因也可以做进化树吗？可以写进文章吗？
基因翻译出来的蛋白质预测二级结构，能写进文章吗？

不做表达做的进化树更准确呢，一般都是以16S rDNA来做遗传分析的DNA，如前面说，翻译后的蛋白质序列是“截短”的。
蛋白质二级结构的话，得看你是做什么目的了，你是要验证什么呢？是基因的功能么？还只是简单的分析其进化程度？如果是基因功能，蛋白质二级结构是必须做的，如果只是分析进化程度，就没有必要了