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happywoheni

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于进化树

我的酶基因克隆出来了,只知道DNA序列,可以做进化树吗?用mega做,是输这个酶基因序列还是翻译后的蛋白序列,还是菌株的基因组啊?
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happywoheni

铁虫 (小有名气)

我用的是酶的DNA序列,好像是Neighbor-Joining,它和用DNAMAN比对后的结果表达的意思一样吗?
我还不太明白进化树反映什么?同源性反映什么?哎,找个明白人问问就好了
3楼2011-08-14 16:12:34
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xbl3688

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


happywoheni(金币+1): 2011-08-14 16:10:41
西瓜(金币+1): 欢迎交流 2011-08-14 18:32:45
是都可以做进化树的
生活的乐趣在于善于发现美,学会欣赏美
2楼2011-08-14 16:09:17
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happywoheni

铁虫 (小有名气)

没做表达,基因也可以做进化树吗?可以写进文章吗?
基因翻译出来的蛋白质预测二级结构,能写进文章吗?
5楼2011-08-14 18:04:14
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

进化树就是反应各序列间的相似度啊,比如保守序列多少,特殊学列多少,然后进行比较,根据已有的规定,可以将不同的序列进行比对,相似度小的进化距离就远,简单说呢,就是保守序列越多,说明越古老。同源性的意思就是它们之间有多少是保守序列,即“来源相同”之表意。
至于做进化树,用DNA可以做,用protein也可以做,但是得根据情况来定,我们上学期有上生物信息学这门课,有说到这些东西,一般用DNA做会比较准确,因为蛋白质毕竟是翻译后的东西,已经省略了很多非编码序列。
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
6楼2011-08-15 09:43:52
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