24小时热门版块排行榜    

查看: 1047  |  回复: 7
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

happywoheni

铁虫 (小有名气)

[求助] 关于进化树

我的酶基因克隆出来了,只知道DNA序列,可以做进化树吗?用mega做,是输这个酶基因序列还是翻译后的蛋白序列,还是菌株的基因组啊?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happywoheni

铁虫 (小有名气)

没做表达,基因也可以做进化树吗?可以写进文章吗?
基因翻译出来的蛋白质预测二级结构,能写进文章吗?
5楼2011-08-14 18:04:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

xbl3688

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


happywoheni(金币+1): 2011-08-14 16:10:41
西瓜(金币+1): 欢迎交流 2011-08-14 18:32:45
是都可以做进化树的
生活的乐趣在于善于发现美,学会欣赏美
2楼2011-08-14 16:09:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

happywoheni

铁虫 (小有名气)

我用的是酶的DNA序列,好像是Neighbor-Joining,它和用DNAMAN比对后的结果表达的意思一样吗?
我还不太明白进化树反映什么?同源性反映什么?哎,找个明白人问问就好了
3楼2011-08-14 16:12:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

416114799

至尊木虫 (知名作家)

进化树就是反应各序列间的相似度啊,比如保守序列多少,特殊学列多少,然后进行比较,根据已有的规定,可以将不同的序列进行比对,相似度小的进化距离就远,简单说呢,就是保守序列越多,说明越古老。同源性的意思就是它们之间有多少是保守序列,即“来源相同”之表意。
至于做进化树,用DNA可以做,用protein也可以做,但是得根据情况来定,我们上学期有上生物信息学这门课,有说到这些东西,一般用DNA做会比较准确,因为蛋白质毕竟是翻译后的东西,已经省略了很多非编码序列。
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
6楼2011-08-15 09:43:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode +12 documentary 2026-08-10 14/700 2026-08-12 15:47 by 医学老男孩
[基金申请] 长年满屏的广告,版主太不责任了。基金也等的急 +3 gltch 2026-08-12 3/150 2026-08-12 13:25 by dcqxinyang
[基金申请] 不应该看fileCode +4 且听虎啸 2026-08-12 4/200 2026-08-12 12:40 by 行无人
[基金申请] 奇怪,两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 10/500 2026-08-12 09:12 by 布布和一二
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
信息提示
请填处理意见