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friya0910

新虫 (正式写手)

[求助] 连接体系的确定

这是我酶切载体和目的基因以后切胶回收的电泳图,左边为载体,右边为目的片段,上样量均为2微升,有没有高手帮我看看我的连接体系中载体和目的片段怎么定量啊?我用的是宝生物的T4连接酶,25微升的体系加1微升的酶和2.5微升的buffer。还有一个问题是连接之后的连接液可以直接做转化么?我看说明书上说还要加醋酸钠,无水乙醇沉淀等!
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peace12039088

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, MolEPI+1): 做多了就可以凭经验来判断了 2011-08-12 17:58:39
楼主做实验很小心谨慎啊,不过事实上做实验是应该如此的。
连接体系你可以按照说明书减半使用或者按比例做成10ul的体系均可,之前我一直使用TaKaRa的连接酶,都是用10ul的连接体系,而且实验室的人都是用10ul的体系。这样的体系不会影响最后的连接效果的。连接产物可以用2-10ul均可,最初我用的少,后来就全部转啦,因为如果出问题,都会重新开始,而不会再用已有的连接液。还有就是感受态也是用50ul左右,很少用100ul的。总之,就是将说明书提供的标准体系都减半(或一半多)使用了。
关于连接中的载体与目标片段的问题。首先没有完全必要按照公式来套,因为回收后的载体及目标片段一般是很难绝对定量的,所以一般人应该都是根据回收后的亮度来作为加入的依据的。但需要注意的一点是,同样亮度的不同大小的片段,大片段的浓度要高于小片段的,所以有了这个前提,就可以凭感觉来加入了,这样讲可能看起来很不敬业的,但事实上就是这样的,你自己尝试几次就可完全领会了。
啰嗦了很多,希望可以对你有用。尽量相信自己,很多人刚开始接触实验,都会有与你类似的疑问和心情。
18楼2011-08-12 10:51:06
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
1楼: Originally posted by friya0910 at 2011-08-11 20:32:26:
这是我酶切载体和目的基因以后切胶回收的电泳图,左边为载体,右边为目的片段,上样量均为2微升,有没有高手帮我看看我的连接体系中载体和目的片段怎么定量啊?我用的是宝生物的T4连接酶,25微升的体系加1微升的酶 ...

补充说明,目的片段283bp,载体5900bp!
2楼2011-08-11 20:36:48
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blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


friya0910(金币+2): 2011-08-11 21:33:22
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-08-11 22:37:29
我们常用的链接体系是:载体1ul;目的片段3.5ul或6ul;NEB或全式金连接酶1ul;连接酶Buffer;加水补足到10ul;转化时,加入的感受态体积至少为50ul,楼主可以试一下,祝楼主顺利!
jiayoubashaonian
3楼2011-08-11 20:57:06
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friya0910

新虫 (正式写手)

西瓜: 一般要计算摩尔比,具体可以在论坛里面搜一下 2011-08-11 22:38:09
引用回帖:
3楼: Originally posted by blackrose8089 at 2011-08-11 20:57:06:
我们常用的链接体系是:载体1ul;目的片段3.5ul或6ul;NEB或全式金连接酶1ul;连接酶Buffer;加水补足到10ul;转化时,加入的感受态体积至少为50ul,楼主可以试一下,祝楼主顺利!

可是连接体系中加入载体和目的片段的量不是要根据你的载体和目的片段的浓度来确定的么?好像是要最终换算成摩尔比的!貌似比较复杂啊!
4楼2011-08-11 21:34:34
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