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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 如何加入Vasp TST Tools，vtstcode按照说明加入，但是vtstscripts怎么用起来？
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slz0811

木虫 (小有名气)

[求助] 如何加入Vasp TST Tools，vtstcode按照说明加入，但是vtstscripts怎么用起来？

按照网站的说明做的。
首先下载解压Tar files  Version 2.04, July 11, 2011
VTST Code: vtstcode.tar.gz
VTST Scripts: vtstscripts.tar.gz
找到 main.F
Find and replace:
      CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &
           LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)
with
      CALL CHAIN_FORCE(T_INFO%NIONS,DYN%POSION,TOTEN,TIFOR, &
          TSIF,LATT_CUR%A,LATT_CUR%B,IO%IU6)
--------------------------------------------------------------------------------
然后修改makefile

Replace the line
  tet.o  hamil.o  steep.o   \
with the lines
         tet.o      hamil.o    steep.o  dimer.o  dynmat.o  neb.o  lanczos.o  instanton.o \
         sd.o       cg.o       qm.o     lbfgs.o  bfgs.o  fire.o   opt.o   \
The objects dynmat.o, neb.o, dimer.o, lanczos.o, and instanton.o must be in the SOURCE list before chain.o appears. The optimizer objects, sd.o, cg.o, qm.o, lbfgs.o, bfgs.o, and fire.o must appear before the optimizer driver opt.o. Nothing else needs to be done. This code will not change the working of any other part of vasp.
上述不知对否，大家看看，指导下。



vtstscripts怎么用起来

我把vtstscripts.tar.gz 解压出来，加了权限。往下就不知怎么做了，大家指导下。
SCRIPTS
--------------------------------------------------------------------------------
The following are a set of scripts to perform common tasks to help with VASP calculations, and particularly with transition state finding. The included Vasp.pm perl module contains several simple routines that are used by many of the scripts.
Download the scripts: vtstscripts.tar.gz
Install by uncompressing this file, and adding the vtstscripts directory to your path.    ???

nebmake.pl    nebmovie.pl   这都需要用到啊。
可是输入命令却显示找不到
[sss@node249 100]# nebmake.pl POSCAR.IS POSCAR.FS 4
-bash: nebmake.pl: command not found
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逢山开路，遇水搭桥。
1楼2011-08-11 16:39:53
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西西弗斯二世

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by liuliuji at 2013-10-22 04:28:20
你好，请问你的问题解决了吗，我现在也遇到这个问题了...

没有呢 后来老板又让我换方向了 不做NEB了  祝你好运
赞一下 回复此楼
9楼2013-10-22 10:03:06
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查看全部 12 个回答

wuli8

荣誉版主 (知名作家)

…………

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
slz0811(金币+10): 谢谢，基本能了。试算下。 2011-08-11 21:29:37
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-08-12 17:31:28
adding the vtstscripts directory to your path.

加入环境变量。我的是.bashrc（隐藏文件）加入这样一句：
export PATH=/export/home/**/vtstscripts:$PATH
PATH=后你你的vtstscripts的目录的路径不能写错了
赞一下(1人) 回复此楼
…………
2楼2011-08-11 18:53:59
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slz0811

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wuli8 at 2011-08-11 18:53:59:
adding the vtstscripts directory to your path.

加入环境变量。我的是.bashrc（隐藏文件）加入这样一句：
export PATH=/export/home/**/vtstscripts:$PATH
PATH=后你你的vtstscripts的目录的路径不能写错了

自己自学vasp，也没人指导，只能在小木虫求助啦。
问题都很简单。

1，以前用的castep，这个算出来直接能看到反应的活化能......那vasp怎么获取活化能呢，OUTCAR里有？还是怎么计算？
2，计算频率，是不是INCAR里把 IBRION = 5 ，或者还要改啥？怎么分析？
3，静态计算，态密度，这些INCAR怎么写。您给发个例子吧，谢谢。
赞一下 回复此楼
逢山开路，遇水搭桥。
3楼2011-08-12 16:34:00
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢提示 2011-08-13 10:54:01
建议看看侯老师的vasp的简明教程，先有个大体的了解再进行计算。
vasp网站上的handon教程也不错，有理论有联系，有助于入门。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-08-12 17:29:41
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