24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3795  |  回复: 20
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 求助:TRFLP 数据分析

各位达人:
小弟目前在用TRFLP 对土壤微生物多样性进行分析。之前实验室没有做过这方面的研究,也是摸着石头过河。毛细管电泳部分交外公司。数据时回来了 但是不是很会分析。知道要做分析要用到一个网站http://mica.ibest.uidaho.edu以及要进行主成分分析。对于这一块很不了解。希望论坛里面有做过这方面工作的对我略略进行指导,将感激不尽!

再次非常感谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

实验分析

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

web1_008

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 老夏853 at 2012-03-04 14:04:17:
能详详细从原理  等等说说嘛 大家分享分享。。。

你好,就是T-RFLP的结果回来以后,利用biodap软件,分析一下,这个软件使用方法很简单,能分析出一些多样性指标和均匀度啥的。OUT,就是把低于50的丰度的条带去掉。剩余有多少条带就是多少OTU,然后计算一些其它的指数。相似性用的是两两比对,二者的相同的条带的个数除以二者总的条带个数。我就分析出了这些,真菌没有比对数据库,所以就没有比对种属啥的。细菌的可以。
9楼2012-03-05 12:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 21 个回答

ureyguo

木虫 (正式写手)

找几篇文献看看啦
2楼2011-07-16 21:49:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by ureyguo at 2011-07-16 21:49:59:
找几篇文献看看啦

呵呵 一般文献只会说 用什么数据库做分析,要么就是说做了 PCA 分析~ 不会详细地说究竟怎么去做 最好是论坛上谁做过这个数据的分析 教教我啊
3楼2011-07-17 14:32:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bear0329

金虫 (正式写手)

我也刚开始做啊,不知道怎么分析呢?现在做了回收,不知道酶切的时候用什么终止反应呢?直接用说明书上的loading buffer 可以么?
以马内利!
4楼2011-07-17 17:32:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +18 花田半亩~白 2026-04-21 18/900 2026-04-23 11:31 by 12021227
[考研] 有没有学校收留 +3 蒋昌鹏qtj 2026-04-20 3/150 2026-04-22 20:25 by 学员JpLReM
[考研] 312求调剂 +3 山河似你温柔 2026-04-22 3/150 2026-04-22 20:17 by 学员JpLReM
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[论文投稿] 急需审稿人!!! +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见