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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

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专业: 食品加工技术

[求助] 求助：TRFLP 数据分析

各位达人：
小弟目前在用TRFLP 对土壤微生物多样性进行分析。之前实验室没有做过这方面的研究，也是摸着石头过河。毛细管电泳部分交外公司。数据时回来了但是不是很会分析。知道要做分析要用到一个网站http://mica.ibest.uidaho.edu以及要进行主成分分析。对于这一块很不了解。希望论坛里面有做过这方面工作的对我略略进行指导，将感激不尽！

再次非常感谢！

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1楼 2011-07-16 21:37:09

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老夏853

铁杆木虫 (著名写手)

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引用回帖:

9楼: Originally posted by web1_008 at 2012-03-05 12:34:46:
你好，就是T-RFLP的结果回来以后，利用biodap软件，分析一下，这个软件使用方法很简单，能分析出一些多样性指标和均匀度啥的。OUT，就是把低于50的丰度的条带去掉。剩余有多少条带就是多少OTU，然后计算一些其它 ...

真菌没有数据库？？
请教下你用的什么引物什么酶还有什么比对网站。。。。