应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » CASTEP过渡态搜索，过渡态能量低于反应物
51/1返回列表
查看: 4897  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

eyreqiao

新虫 (小有名气)

[交流] CASTEP过渡态搜索，过渡态能量低于反应物 已有8人参与

利用CASTEP的过渡态搜索，研究单个原子在表面不同位置之间的扩散。
complete LST/QST，过渡态搜索显示成功，但是结果文件中给出的过渡态能量在反应物之下（扩散路径设置的从能量高的吸附位到能量低的吸附位），这是怎么回事，难道说明这个扩散反应没有势垒？还是我找到的是一个中间的亚稳态？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

MS第一性原理 计算材料帖子整理

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-07-12 12:50:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hxwyy2005

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
您好！请问最后反应的势垒是多少啊？是用您帖子中的Barrier from reactant:                   0.00603 eV                           
吗？
赞一下 回复此楼
9楼2013-03-14 10:15:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

eyreqiao

新虫 (小有名气)
自己顶一下

一下为CASTEP结果文件给出的信息


Transition State Found!
Energy of reactant:                 -43366.78455 eV                           
Energy of product:                  -43368.65073 eV                           
Energy of transition state:         -43366.89768 eV                           
Location of transition state:            0.38671
Barrier from reactant:                  -0.11313 eV                           
Barrier from product:                    1.75305 eV                           
Energy of reaction:                     -1.86618 eV
赞一下 回复此楼
2楼2011-07-13 09:19:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cavediger

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zzy870720z(金币+2): 鼓励交流 2011-07-14 09:37:13
引用回帖:
Originally posted by eyreqiao at 2011-07-12 12:50:09:
利用CASTEP的过渡态搜索，研究单个原子在表面不同位置之间的扩散。
complete LST/QST，过渡态搜索显示成功，但是结果文件中给出的过渡态能量在反应物之下（扩散路径设置的从能量高的吸附位到能量低的吸附位），这 ...

考虑两个问题：
1. 反应物结构选择是否正确，是否优化到了基态？
2. 如果像你图中所示的那样，TS掉下去了，追踪一下迭代过程，考虑是否计算过程出了问题；如果没有问题，那么考虑一下是否存在反应中间物种，针对你的情况，就是是否存在扩散中间态，需要分布考虑扩散过程。
赞一下(2人) 回复此楼
我们都老得太快，却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅，蓦然发现，本来就有一条笔直的路，直达山顶....
3楼2011-07-13 09:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

eyreqiao

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by cavediger at 2011-07-13 09:43:27:
考虑两个问题：
1. 反应物结构选择是否正确，是否优化到了基态？
2. 如果像你图中所示的那样，TS掉下去了，追踪一下迭代过程，考虑是否计算过程出了问题；如果没有问题，那么考虑一下是否存在反应中间物种， ...

谢谢!
又重新进行了计算。这次把精度提高为fine，原来为medium，这样rms convergenc 变为0.05

计算结果如下
Transition State Found!
Energy of reactant:                 -43366.78453 eV                           
Energy of product:                  -43368.65072 eV                           
Energy of transition state:         -43366.77850 eV                           
Location of transition state:            0.03827
Barrier from reactant:                   0.00603 eV                           
Barrier from product:                    1.87223 eV                           
Energy of reaction:                     -1.86620 eV

从上述数据看是有一个很小很小的势垒，但这和使用medium精度的计算结果矛盾！
计算精度的影响会这么大吗？
rms是什么意思？

计算的曲线如下，从中看好像过渡态的能量还是低于反应物呀！

那位大小给具体解释下，图中的几个曲线都是什么意思，科普一下吧，谢谢。
赞一下 回复此楼
4楼2011-07-13 14:42:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +16 花田半亩～白 2026-04-21 16/800 2026-04-23 03:04 by 魅力紫翼
[考研] 有没有学校收留 +3 蒋昌鹏qtj 2026-04-20 3/150 2026-04-22 20:25 by 学员JpLReM
[考研] 312求调剂 +3 山河似你温柔 2026-04-22 3/150 2026-04-22 20:17 by 学员JpLReM
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +5 yexuqing 2026-04-19 5/250 2026-04-22 10:01 by easeheart
[论文投稿] 急需审稿人！！！ +3 陆小果画大饼 2026-04-21 3/150 2026-04-21 23:54 by jzy_123456
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭