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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » CASTEP过渡态搜索，过渡态能量低于反应物
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eyreqiao

新虫 (小有名气)

[交流] CASTEP过渡态搜索，过渡态能量低于反应物 已有8人参与

利用CASTEP的过渡态搜索，研究单个原子在表面不同位置之间的扩散。
complete LST/QST，过渡态搜索显示成功，但是结果文件中给出的过渡态能量在反应物之下（扩散路径设置的从能量高的吸附位到能量低的吸附位），这是怎么回事，难道说明这个扩散反应没有势垒？还是我找到的是一个中间的亚稳态？
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1楼 2011-07-12 12:50:09
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xx4751

铜虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好，想问一下，我的过渡态搜索成功了，势的形状怎么得到，现在只有势垒大小和过渡态的能量
赞一下(2人) 回复此楼
8楼2012-11-15 14:10:38
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eyreqiao

新虫 (小有名气)
自己顶一下

一下为CASTEP结果文件给出的信息


Transition State Found!
Energy of reactant:                 -43366.78455 eV                           
Energy of product:                  -43368.65073 eV                           
Energy of transition state:         -43366.89768 eV                           
Location of transition state:            0.38671
Barrier from reactant:                  -0.11313 eV                           
Barrier from product:                    1.75305 eV                           
Energy of reaction:                     -1.86618 eV
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2楼2011-07-13 09:19:02
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cavediger

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zzy870720z(金币+2): 鼓励交流 2011-07-14 09:37:13
引用回帖:
Originally posted by eyreqiao at 2011-07-12 12:50:09:
利用CASTEP的过渡态搜索，研究单个原子在表面不同位置之间的扩散。
complete LST/QST，过渡态搜索显示成功，但是结果文件中给出的过渡态能量在反应物之下（扩散路径设置的从能量高的吸附位到能量低的吸附位），这 ...

考虑两个问题：
1. 反应物结构选择是否正确，是否优化到了基态？
2. 如果像你图中所示的那样，TS掉下去了，追踪一下迭代过程，考虑是否计算过程出了问题；如果没有问题，那么考虑一下是否存在反应中间物种，针对你的情况，就是是否存在扩散中间态，需要分布考虑扩散过程。
赞一下(2人) 回复此楼
我们都老得太快，却聪明得太迟。当我一路跌跌撞撞登上山巅，蓦然发现，本来就有一条笔直的路，直达山顶....
3楼2011-07-13 09:43:27
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eyreqiao

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by cavediger at 2011-07-13 09:43:27:
考虑两个问题：
1. 反应物结构选择是否正确，是否优化到了基态？
2. 如果像你图中所示的那样，TS掉下去了，追踪一下迭代过程，考虑是否计算过程出了问题；如果没有问题，那么考虑一下是否存在反应中间物种， ...

谢谢!
又重新进行了计算。这次把精度提高为fine，原来为medium，这样rms convergenc 变为0.05

计算结果如下
Transition State Found!
Energy of reactant:                 -43366.78453 eV                           
Energy of product:                  -43368.65072 eV                           
Energy of transition state:         -43366.77850 eV                           
Location of transition state:            0.03827
Barrier from reactant:                   0.00603 eV                           
Barrier from product:                    1.87223 eV                           
Energy of reaction:                     -1.86620 eV

从上述数据看是有一个很小很小的势垒，但这和使用medium精度的计算结果矛盾！
计算精度的影响会这么大吗？
rms是什么意思？

计算的曲线如下，从中看好像过渡态的能量还是低于反应物呀！

那位大小给具体解释下，图中的几个曲线都是什么意思，科普一下吧，谢谢。
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4楼2011-07-13 14:42:25
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