应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 用DS中ligandFit来做对接遇到无法定义input Binding site
41/1返回列表
查看: 1120  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

leirongjian

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 用DS中ligandFit来做对接遇到无法定义input Binding site

用DS中ligandFit来做对接，在定义input Binding site 的时候，采用了LibDock中input site sphere 一样的步骤(即define sphere from selection),但是一直不行，请问input site sphere 和input Binding site 有什么区别？如何去定义ligandFit中的input Binding site？谢谢回答！
回复此楼

» 猜你喜欢
珍惜有阳光、健康的时光！
1楼 2011-06-23 15:05:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

痴梦潇湘

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-06-25 10:20:41
leirongjian(金币+15): 谢谢，可以! 2011-06-27 12:52:38
选中蛋白，按以下步骤操作：
Define selected molecule as receptor
Find site from receptor cavities
找到你研究的那个site（一般第一个就是）
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-06-24 18:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

克罗米虎

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-06-26 22:04:06
有个小BUG，你把选中的部分（一般是配体）先剪切一下再原地复制，就可以define了
赞一下(1人) 回复此楼
专业的计算模拟服务：http://www.wecomput.com
3楼2011-06-26 12:34:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

FAD

新虫 (初入文坛)
请问楼主解决了吗？我也是这个问题。然后我把的步骤重新梳理了下，发现没有错。不知道为何

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2019-09-07 17:30:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 leirongjian 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 275求调剂 +7 Micky11223 2026-03-25 9/450 2026-03-26 14:48 by 。。堂堂
[考研] 0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可 +5 丹青奶盖 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:55 by 0906ljy
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 296求调剂 +4 汪！？！ 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪！？！
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
[考研] 生物学学硕求调剂 +7 小羊睡着了? 2026-03-23 10/500 2026-03-25 02:24 by 清风拂扬。 m
[考研] 材料调剂 +6 匹克i 2026-03-23 6/300 2026-03-24 21:09 by greychen00
[考研] 292求调剂 +4 鹅鹅鹅额额额额� 2026-03-24 4/200 2026-03-24 16:41 by peike
[考研] 300求调剂，材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 【双一流院校新能源、环境材料，材料加工与模拟招收大量调剂】 +4 Higraduate 2026-03-22 7/350 2026-03-24 11:23 by 种大树
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗？ +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +6 ￣^￣゜汗 2026-03-19 9/450 2026-03-23 19:53 by pswait
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
[考研] 一志愿华中农业071010，总分320求调剂 +5 困困困困坤坤 2026-03-20 6/300 2026-03-22 17:41 by hxsm
[考研] 一志愿中南化学（0703）总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 一志愿深大，0703化学，总分302，求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭