应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond di
51/1返回列表
查看: 1469  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

yangger

新虫 (初入文坛)

[求助] 导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond di

导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond distances greater than 0.0 angstrom. they will be shown as bonds. you may wish to edit them.
不知这个该怎么改？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
fd
1楼 2011-06-21 18:37:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangger

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-06-22 09:24:54:
用其他的软件打开，在另存为那个格式的文件，然后再用你的软件打开就可以了

你说的其他软件可以是diamond或者findit么？
赞一下 回复此楼
fd
5楼2011-06-22 10:03:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

qingyun555

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
贺仪(金币+1): 多谢交流 2011-06-22 09:24:02
引用回帖:
Originally posted by yangger at 2011-06-21 18:37:25:
导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond distances greater than 0.0 angstrom. they will be shown as bonds. you may wish to edit them.
不知这个该怎么改？

不知楼主cif文件是从哪个数据库导出的? 用的是哪种MS版本呢？

一般现在较高级的版本导入cif都出问题
很多时候甚至是导不进去，导进去时容易出错，最好自己按cif数据手动导入
根据报错，是MS识别有些键的合理性问题
可以尝试modify_bonds 调节下
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-06-21 22:28:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-06-22 10:05:41
yangger(金币+3): xiexie 2011-06-22 10:34:52
用其他的软件打开，在另存为那个格式的文件，然后再用你的软件打开就可以了
赞一下(1人) 回复此楼
嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2011-06-22 09:24:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangger

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by qingyun555 at 2011-06-21 22:28:26:
不知楼主cif文件是从哪个数据库导出的? 用的是哪种MS版本呢？

一般现在较高级的版本导入cif都出问题
很多时候甚至是导不进去，导进去时容易出错，最好自己按cif数据手动导入
根据报错，是MS识别有些键的合 ...

怎么样手动cif数据导入？ symmetry和晶格常数，我知道怎么填入，但是键长和键角不知道在哪里设置？ 一共有28个原子
赞一下 回复此楼
fd
4楼2011-06-22 10:01:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 5/250 2026-08-23 12:09 by LR9qGULyN2ew
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 9/450 2026-08-23 10:59 by Tide man
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12 大萍1987 2026-08-20 14/700 2026-08-23 10:30 by wrm
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭