应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond di
51/1返回列表
查看: 1240  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

yangger

新虫 (初入文坛)

[求助] 导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond di

导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond distances greater than 0.0 angstrom. they will be shown as bonds. you may wish to edit them.
不知这个该怎么改？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
fd
1楼 2011-06-21 18:37:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-06-22 10:05:41
yangger(金币+3): xiexie 2011-06-22 10:34:52
用其他的软件打开，在另存为那个格式的文件，然后再用你的软件打开就可以了
赞一下(1人) 回复此楼
嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2011-06-22 09:24:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

qingyun555

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
贺仪(金币+1): 多谢交流 2011-06-22 09:24:02
引用回帖:
Originally posted by yangger at 2011-06-21 18:37:25:
导入cif文件，已有结构，但是在计算时报错说：data block yy contains bond distances greater than 0.0 angstrom. they will be shown as bonds. you may wish to edit them.
不知这个该怎么改？

不知楼主cif文件是从哪个数据库导出的? 用的是哪种MS版本呢？

一般现在较高级的版本导入cif都出问题
很多时候甚至是导不进去，导进去时容易出错，最好自己按cif数据手动导入
根据报错，是MS识别有些键的合理性问题
可以尝试modify_bonds 调节下
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-06-21 22:28:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangger

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by qingyun555 at 2011-06-21 22:28:26:
不知楼主cif文件是从哪个数据库导出的? 用的是哪种MS版本呢？

一般现在较高级的版本导入cif都出问题
很多时候甚至是导不进去，导进去时容易出错，最好自己按cif数据手动导入
根据报错，是MS识别有些键的合 ...

怎么样手动cif数据导入？ symmetry和晶格常数，我知道怎么填入，但是键长和键角不知道在哪里设置？ 一共有28个原子
赞一下 回复此楼
fd
4楼2011-06-22 10:01:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangger

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-06-22 09:24:54:
用其他的软件打开，在另存为那个格式的文件，然后再用你的软件打开就可以了

你说的其他软件可以是diamond或者findit么？
赞一下 回复此楼
fd
5楼2011-06-22 10:03:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 301求调剂 +3 149. 2026-04-10 3/150 2026-04-10 12:25 by ajpv风雷
[考研] 一志愿沪9，326生物学求相关专业调剂 +4 刘墨墨 2026-04-09 4/200 2026-04-10 12:07 by pengliang8036
[考研] 材料与化工371求调剂 +17 陪琳看海 2026-04-04 18/900 2026-04-10 07:51 by 314126402
[考研] 283求调剂，工科！ +8 苏打水7777 2026-04-08 8/400 2026-04-09 20:50 by xujun0624
[考研] 0860004 求调剂 309分 +7 Yin DY 2026-04-08 7/350 2026-04-09 14:06 by ditto77778
[考研] 求助071001调剂！！！ +7 黄守松 2026-04-05 8/400 2026-04-09 09:07 by 徐良白眉大侠
[考研] 求调剂 +7 chenxrlkx 2026-04-05 9/450 2026-04-09 09:04 by wj165256
[考研] 材料科学与工程320求调剂，080500 +12 黄瓜味薯片 2026-04-06 12/600 2026-04-08 16:26 by luoyongfeng
[考研] 304求调剂 +10 素年祭语 2026-04-06 17/850 2026-04-08 09:05 by 蓝云思雨
[考研] 307求调剂 +14 超级伊昂大王 2026-04-06 14/700 2026-04-08 07:03 by 无际的草原
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 372分材料与化工（085600）英二数二求调剂 +4 蓝笺片 2026-04-06 4/200 2026-04-07 12:30 by dongzh2009
[考研] 22408 331分求调剂 +4 y__1 2026-04-06 4/200 2026-04-06 17:26 by 土木硕士招生
[考研] 材料工程310专硕调剂 +14 捞捞我…. 2026-04-04 15/750 2026-04-06 14:18 by lqwchd
[考研] 一志愿武汉理工大学080200机械工程308分，求调剂 +4 终不似从前 2026-04-05 4/200 2026-04-06 11:46 by 考研学校招点人
[考研] 319求调剂 +3 handrui 2026-04-05 3/150 2026-04-06 09:33 by jp9609
[考研] 考研调剂 +5 美丽的youth_ 2026-04-04 6/300 2026-04-06 06:57 by houyaoxu
[考研] 能动调剂326专硕 +4 wan112233 2026-04-04 4/200 2026-04-04 22:47 by yu221
[考研] 怎么删帖子啊 +3 缝曦1000 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:20 by 土木硕士招生
[考研] 求生物学专业调剂-332分 +5 云朵遛弯指南 2026-04-04 5/250 2026-04-04 10:05 by rzh123456
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭