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7788945

银虫 (小有名气)


[交流] 那些基因可以反映组织内ATP的浓度?

如果细胞内ATP合成途径中某部分受阻,ATP含量下降,那些基因可以被ATP减少所诱导,迅速反映出这种变化呢?就想Mt4基因可以受到磷酸盐浓度的影响,作为一种指示基因,那些可以作为ATP的指示基因?
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gwbk

木虫 (正式写手)


★ ★
西瓜(金币+2): 鼓励交流。楼主说的不是ATP合成相关基因的变化啦,而是受ATP浓度影响的基因有哪些。 2011-06-18 10:28:41
7788945(金币+1): 2011-06-18 12:09:49
你肿么老想着转录水平变化呢

1,这个问题看起来很复杂。从ATP合成机制上看,无论是底物水平磷酸化,还是氧化磷酸化的ATP合成酶合成ATP,这些相关基因在组织细胞内表达不会受环境变化而变化。之所以这么想,是因为葡萄糖、脂肪降解是ATP的最终来源。最终实现ATP或者NADH、FADH2转化的是糖酵解、TCA、脂肪氧化进入TCA。没有考证TCA各个酶受诱导情况,但是我觉得,这些基因的表达,不受外界信号变化而变化。

2,你说的加一些抑制剂,解偶联剂,解除氧化磷酸化欧联从而降低ATP合成,ATP合成减少,随着ATP被利用,ADP增多,肯定会引起组织细胞一些列变化,但我了解到的都是生理生化上的变化。比如线粒体的紧缩态和活动态的转变。但是好像没有进一步诱导ATP合酶、NADH、FADH2氧化磷酸化电子传递链蛋白对应的这些管家基因的变化。

3,ATP好像与第二信使cAMP信号传导除了底物与产物的关系,并没有信号上的关系。

总结:
1,无论是糖酵解、TCA、脂肪氧化,还是ATP合酶、电子递链蛋白系统、cAMP。细胞生理生化变化,转录水平好像没有什么变化。
2,ATP减少会引起葡萄糖、脂肪的加速降解,但是资料上找不到转录水平的变化。
3,水平有限,期待高手。
4楼2011-06-17 22:58:15
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gwbk

木虫 (正式写手)



7788945(金币+1):谢谢参与
7788945(金币+1): 2011-06-18 12:09:57
我觉得应该这样理解这个问题,ATP是所有细胞必须的,相关基因可能是管家基因。管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调节。

我的说法只是一个猜测。请专家回答这个深度问题。
2楼2011-06-17 15:50:39
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7788945

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by gwbk at 2011-06-17 15:50:39:
我觉得应该这样理解这个问题,ATP是所有细胞必须的,相关基因可能是管家基因。管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表达,或变化很小。它的表达只受启动序 ...

合成ATP的基因肯定是恒定表达,比如ATP合成酶的各亚基恒定表达,但如果人为的加上某条件去阻断ATP的合成,比如使用鱼藤酮,氰化物阻断正常的呼吸链,ATP的合成应该减少(即使抗氰呼吸增强,ATP的量也应比正常呼吸少),这个时候哪些基因会响应ATP的减少,而在转录水平发生较大变化?
3楼2011-06-17 16:22:12
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7788945(金币+1):谢谢参与
7788945(金币+1): 2011-06-18 12:09:44
ATP不清楚,个人认为应该是有不少基因受ATP浓度影响的。

刚试了下google“ATP-dependent gene"有不少结果,楼主可以试试。

可以在相关文献中查找“ATP level”,看看别人是怎么确定"ATP level"的,如果用的是某些基因的表达量(荧光定量PCR或者Western Blot”的结果),那么这些基因就是楼主需要的啦。

外行意见,仅供参考

[ Last edited by 西瓜 on 2011-6-18 at 10:39 ]
5楼2011-06-18 10:32:19
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li2219189楼
2011-06-18 12:27   回复  
7788945(金币+1):谢谢参与
1949stone: 这都可以啊 2011-06-19 20:23:35
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