24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2045  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

[求助] ONIOM的Error imposing constraints错误

最近用ONIOM对氧化锌cluster优化时总出错,高手出来指点一下吧,谢谢了。
我按照小木虫上的经验,先将体系都设成low层,用分子动力学进行了测试,和分层时候的错误是一样的。我的输入文件:
%chk=5.chk
%mem=1500MB
%nprocs=6
#p opt pm3 iop(5/13=1) test

Zn60O60(100)

0 1
O               -1   -6.56590000    1.62460000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    4.59430000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    6.49850000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    9.74780000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000    7.19700000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000   12.40250000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   15.61630000 L


输出文件:
New curvilinear step failed, DQL= 7.02D+00 SP=-2.06D-01.
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.07083751 RMS(Int)=  0.16326873
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.01446703 RMS(Int)=  0.10854532
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.01023580 RMS(Int)=  0.15224388
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.01403792 RMS(Int)=  0.13226878
Old curvilinear step not converged, using linear step
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.00036482 RMS(Int)=  0.00046129
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001781 RMS(Int)=  0.00048441
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001657 RMS(Int)=  0.00060400
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.00003574 RMS(Int)=  0.00105301
Old curvilinear step not converged, using linear step
Error imposing constraints
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 12:05:02 2011.
我冻结了部分原子,怀疑是冻结的问题,但是文献也是冻结的,文献优化完的结构几乎没变。

---------------
如果不冻结原子,结构变化很大,不是我想要的了,而且出现下面错误:
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 22:37:39 2011.

[ Last edited by cj4566 on 2011-6-16 at 20:41 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 冬天里的骄阳 at 2011-06-17 10:34:02:
补充:
lz的冻结选择并不好,起码我按照你给定的格式优化,结构变化很大,按参考文献再认真选择合适的冻结原子吧

恩  结构是有点问题,后来修改了又出现新的错误,麻烦高手指点一下。。。
6楼2011-06-17 11:10:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

cj4566

木虫 (正式写手)

怎么没人回答呢?
2楼2011-06-17 07:09:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cj4566(金币+10): 谢谢! 2011-06-17 11:10:36
参考文献J. Phys. Chem. C, 2009, 113 (4), pp 1474–1485
话说PM3并不是分子动力学吧
你这个结构我优化了一下,没有你说的那个错误
3楼2011-06-17 10:31:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

补充:
lz的冻结选择并不好,起码我按照你给定的格式优化,结构变化很大,按参考文献再认真选择合适的冻结原子吧
4楼2011-06-17 10:34:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 初试324 中药学 一志愿天中医 求调剂 +3 李的Lucky 2026-04-10 3/150 2026-04-15 23:54 by 陈皮皮
[考研] 271求调剂 +32 2261744733 2026-04-11 33/1650 2026-04-15 22:03 by noqvsozv
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-15 8/400 2026-04-15 21:47 by lbsjt
[考研] 通信工程求调剂!!! +6 zlb770521 2026-04-14 6/300 2026-04-15 20:00 by 学员JpLReM
[考研] 生物学调剂 +9 纸扇zhishan 2026-04-13 9/450 2026-04-15 18:28 by AN流800
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +11 河南农业大学-能 2026-04-14 11/550 2026-04-15 15:03 by 学员JpLReM
[考研] 22专硕求调剂 +9 haoyun上岸 2026-04-11 11/550 2026-04-15 14:47 by elainzaizai
[考研] 化学070300 求调剂 +23 哈哈哈^_^ 2026-04-12 23/1150 2026-04-14 16:30 by zhouxiaoyu
[考研] 各位老师好,求调剂,本科211,一志愿天津大学生物与医药学硕,差两名录取。 +11 路六六jjj 2026-04-13 11/550 2026-04-14 16:01 by zs92450
[考研] 366求调剂 +11 不知名的小卅 2026-04-11 11/550 2026-04-14 15:50 by zs92450
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+6 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 28/1400 2026-04-14 15:44 by zs92450
[考研] 求调剂 +20 MAX怅惘 2026-04-09 22/1100 2026-04-14 14:57 by 独醉梦孤城
[考研] 材料085601调剂 +32 何润采123 2026-04-10 34/1700 2026-04-14 08:47 by 木木mumu~
[考研] 材料复试求调剂 +24 xhhdjdjsjks 2026-04-09 24/1200 2026-04-13 15:49 by 幸免 ..
[考研] 314求调剂 +24 wakeluofu 2026-04-09 25/1250 2026-04-13 08:58 by lhj2009
[考研] 0831生医工第一轮调剂失败求助 +12 小熊睿睿_s 2026-04-11 16/800 2026-04-12 16:28 by 钰璞
[考研] 270求调剂 +14 杨乐369 2026-04-11 14/700 2026-04-11 20:16 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿985机械学硕380求调剂 +5 关关雎鸠10 2026-04-11 5/250 2026-04-11 10:10 by 知念。A
[考研] 282,电气工程专业,求调剂,不挑专业 +9 jggshjkkm 2026-04-10 9/450 2026-04-10 14:55 by 逆水乘风
[考研] 求调剂 +11 翩翩一书生 2026-04-09 13/650 2026-04-10 10:27 by liuhuiying09
信息提示
请填处理意见