24小时热门版块排行榜    

查看: 2312  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

[求助] ONIOM的Error imposing constraints错误

最近用ONIOM对氧化锌cluster优化时总出错,高手出来指点一下吧,谢谢了。
我按照小木虫上的经验,先将体系都设成low层,用分子动力学进行了测试,和分层时候的错误是一样的。我的输入文件:
%chk=5.chk
%mem=1500MB
%nprocs=6
#p opt pm3 iop(5/13=1) test

Zn60O60(100)

0 1
O               -1   -6.56590000    1.62460000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    4.59430000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    6.49850000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    9.74780000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000    7.19700000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000   12.40250000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   15.61630000 L


输出文件:
New curvilinear step failed, DQL= 7.02D+00 SP=-2.06D-01.
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.07083751 RMS(Int)=  0.16326873
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.01446703 RMS(Int)=  0.10854532
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.01023580 RMS(Int)=  0.15224388
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.01403792 RMS(Int)=  0.13226878
Old curvilinear step not converged, using linear step
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.00036482 RMS(Int)=  0.00046129
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001781 RMS(Int)=  0.00048441
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001657 RMS(Int)=  0.00060400
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.00003574 RMS(Int)=  0.00105301
Old curvilinear step not converged, using linear step
Error imposing constraints
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 12:05:02 2011.
我冻结了部分原子,怀疑是冻结的问题,但是文献也是冻结的,文献优化完的结构几乎没变。

---------------
如果不冻结原子,结构变化很大,不是我想要的了,而且出现下面错误:
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 22:37:39 2011.

[ Last edited by cj4566 on 2011-6-16 at 20:41 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 冬天里的骄阳 at 2011-06-17 10:34:02:
补充:
lz的冻结选择并不好,起码我按照你给定的格式优化,结构变化很大,按参考文献再认真选择合适的冻结原子吧

恩  结构是有点问题,后来修改了又出现新的错误,麻烦高手指点一下。。。
6楼2011-06-17 11:10:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

cj4566

木虫 (正式写手)

怎么没人回答呢?
2楼2011-06-17 07:09:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cj4566(金币+10): 谢谢! 2011-06-17 11:10:36
参考文献J. Phys. Chem. C, 2009, 113 (4), pp 1474–1485
话说PM3并不是分子动力学吧
你这个结构我优化了一下,没有你说的那个错误
3楼2011-06-17 10:31:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

补充:
lz的冻结选择并不好,起码我按照你给定的格式优化,结构变化很大,按参考文献再认真选择合适的冻结原子吧
4楼2011-06-17 10:34:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +5 zju2000 2026-08-16 5/250 2026-08-16 23:23 by Haru815
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +3 Tide man 2026-08-14 3/150 2026-08-16 17:47 by jurkat.1640
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +10 majunge000 2026-08-11 12/600 2026-08-16 08:18 by xli1984
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +6 wangze12014 2026-08-14 7/350 2026-08-15 20:12 by gltch
[基金申请] filecode +8 cratir 2026-08-14 12/600 2026-08-15 18:08 by zyfgau
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +10 majunge000 2026-08-10 13/650 2026-08-15 12:26 by hanpeng972
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见