24小时热门版块排行榜    

查看: 1991  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

[求助] ONIOM的Error imposing constraints错误

最近用ONIOM对氧化锌cluster优化时总出错,高手出来指点一下吧,谢谢了。
我按照小木虫上的经验,先将体系都设成low层,用分子动力学进行了测试,和分层时候的错误是一样的。我的输入文件:
%chk=5.chk
%mem=1500MB
%nprocs=6
#p opt pm3 iop(5/13=1) test

Zn60O60(100)

0 1
O               -1   -6.56590000    1.62460000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    4.59430000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    6.49850000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    9.74780000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000    7.19700000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000   12.40250000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   15.61630000 L


输出文件:
New curvilinear step failed, DQL= 7.02D+00 SP=-2.06D-01.
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.07083751 RMS(Int)=  0.16326873
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.01446703 RMS(Int)=  0.10854532
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.01023580 RMS(Int)=  0.15224388
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.01403792 RMS(Int)=  0.13226878
Old curvilinear step not converged, using linear step
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.00036482 RMS(Int)=  0.00046129
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001781 RMS(Int)=  0.00048441
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001657 RMS(Int)=  0.00060400
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.00003574 RMS(Int)=  0.00105301
Old curvilinear step not converged, using linear step
Error imposing constraints
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 12:05:02 2011.
我冻结了部分原子,怀疑是冻结的问题,但是文献也是冻结的,文献优化完的结构几乎没变。

---------------
如果不冻结原子,结构变化很大,不是我想要的了,而且出现下面错误:
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 22:37:39 2011.

[ Last edited by cj4566 on 2011-6-16 at 20:41 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

补充:
lz的冻结选择并不好,起码我按照你给定的格式优化,结构变化很大,按参考文献再认真选择合适的冻结原子吧
4楼2011-06-17 10:34:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

cj4566

木虫 (正式写手)

怎么没人回答呢?
2楼2011-06-17 07:09:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cj4566(金币+10): 谢谢! 2011-06-17 11:10:36
参考文献J. Phys. Chem. C, 2009, 113 (4), pp 1474–1485
话说PM3并不是分子动力学吧
你这个结构我优化了一下,没有你说的那个错误
3楼2011-06-17 10:31:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 冬天里的骄阳 at 2011-06-17 10:31:28:
参考文献J. Phys. Chem. C, 2009, 113 (4), pp 1474–1485
话说PM3并不是分子动力学吧
你这个结构我优化了一下,没有你说的那个错误

太感激了,很奇怪为什么我按上面的计算会有那错误。我就是找上面的哪文献做的,今天发现结构有点不一样,然后改过来按文献方法又算了,出现 Error in internal coordinate system.错误。这次的输入文件:
%chk=01.chk
%mem=2000MB
%nprocs=6
#p opt oniom(b3lyp/lanl2dz:pm3) iop(5/13=1) test

ZnO (-1 0 0)

0 1 0 1 0 1
O               -1    4.68990000    1.62460000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    0.00000000    4.59430000 L
Zn              -1    6.56590000    1.62460000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000    1.62460000    7.19700000 L
Zn              -1    4.68990000    1.62460000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000    1.62460000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    0.00000000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    0.00000000    9.79980000 L
Zn              -1    6.56590000    1.62460000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000    1.62460000   12.40250000 L
Zn              -1    4.68990000    1.62460000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000    1.62460000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    0.00000000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    0.00000000   15.00520000 L
Zn              -1    6.56590000    1.62460000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000    3.24930000    4.59430000 L
O               -1    4.68990000    4.87390000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    3.24930000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000    4.87390000    5.20540000 L H 20
O                0    0.93800000    4.87390000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000    3.24930000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000    3.24930000    7.19700000 L
Zn              -1    6.56590000    4.87390000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000    4.87390000    7.19700000 L
Zn              -1    1.87600000    3.24930000    7.80820000 L H 20
O               -1    1.87600000    3.24930000    9.79980000 L H 31
Zn              -1    4.68990000    4.87390000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000    4.87390000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    3.24930000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    3.24930000    9.79980000 L
Zn               0    0.93800000    4.87390000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000    4.87390000   12.40250000 L H 31
Zn              -1    3.75190000    3.24930000   10.41090000 L
O               -1    3.75190000    3.24930000   12.40250000 L
Zn              -1    6.56590000    4.87390000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000    4.87390000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000    3.24930000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000    3.24930000   15.00520000 L
Zn              -1    4.68990000    4.87390000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000    4.87390000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    3.24930000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    3.24930000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000    4.87390000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000    3.24930000   15.61630000 L
Zn              -1    6.56590000    4.87390000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000    6.49850000    4.59430000 L
O               -1    4.68990000    8.12320000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    6.49850000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000    8.12320000    5.20540000 L H 50
O                0    0.93800000    8.12320000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000    6.49850000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000    6.49850000    7.19700000 L H 55
Zn              -1    6.56590000    8.12320000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000    8.12320000    7.19700000 L
Zn               0    1.87600000    6.49850000    7.80820000 H
O                0    1.87600000    6.49850000    9.79980000 H
Zn              -1    4.68990000    8.12320000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000    8.12320000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    6.49850000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    6.49850000    9.79980000 L
Zn               0    0.93800000    8.12320000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000    8.12320000   12.40250000 L H 61
Zn              -1    3.75190000    6.49850000   10.41090000 L H 56
O               -1    3.75190000    6.49850000   12.40250000 L
Zn              -1    6.56590000    8.12320000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000    8.12320000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000    6.49850000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000    6.49850000   15.00520000 L
Zn              -1    4.68990000    8.12320000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000    8.12320000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    6.49850000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    6.49850000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000    8.12320000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000    6.49850000   15.61630000 L
Zn              -1    6.56590000    8.12320000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000    9.74780000    4.59430000 L
O               -1    4.68990000   11.37240000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    9.74780000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000   11.37240000    5.20540000 L H 80
O                0    0.93800000   11.37240000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000    9.74780000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000    9.74780000    7.19700000 L H 85
Zn              -1    6.56590000   11.37240000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000   11.37240000    7.19700000 L
Zn               0    1.87600000    9.74780000    7.80820000 H
O                0    1.87600000    9.74780000    9.79980000 H
Zn              -1    4.68990000   11.37240000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000   11.37240000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    9.74780000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    9.74780000    9.79980000 L
Zn               0    0.93800000   11.37240000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000   11.37240000   12.40250000 L H 91
Zn              -1    3.75190000    9.74780000   10.41090000 L H 86
O               -1    3.75190000    9.74780000   12.40250000 L
Zn              -1    6.56590000   11.37240000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000   11.37240000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000    9.74780000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000    9.74780000   15.00520000 L
Zn              -1    4.68990000   11.37240000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000   11.37240000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    9.74780000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    9.74780000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000   11.37240000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000    9.74780000   15.61630000 L
Zn              -1    6.56590000   11.37240000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000   12.99710000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000   14.62170000    5.20540000 L H 108
O                0    0.93800000   14.62170000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000   12.99710000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000   12.99710000    7.19700000 L H 111
Zn               0    1.87600000   12.99710000    7.80820000 H
O                0    1.87600000   12.99710000    9.79980000 H
Zn               0    0.93800000   14.62170000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000   14.62170000   12.40250000 L H 113
Zn              -1    3.75190000   12.99710000   10.41090000 L H 112
O               -1    3.75190000   12.99710000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000   12.99710000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000   12.99710000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000   14.62170000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000   12.99710000   15.61630000 L

输出文件:
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Fri Jun 17 10:49:22 2011.
这是什么原因呢?谢谢了
我是高斯纯新手,PM3是什么都没查,不好意思啊,以为oniom的low层都用分子动力学。
5楼2011-06-17 11:08:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0805 316求调剂 +6 大雪深藏 2026-03-18 6/300 2026-03-24 22:13 by peike
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-24 3/150 2026-03-24 21:31 by peike
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 293求调剂 +6 加一一九 2026-03-24 6/300 2026-03-24 14:29 by JourneyLucky
[考研] 工科0856求调剂 +5 沐析汀汀 2026-03-21 5/250 2026-03-23 17:56 by 海瑟薇-
[考研] 306求调剂 +9 chuanzhu川烛 2026-03-18 9/450 2026-03-23 13:17 by luoyongfeng
[考研] 石河子大学(211、双一流)硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 289求调剂 +7 怀瑾握瑜l 2026-03-20 7/350 2026-03-22 15:57 by ColorlessPI
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 一志愿华中科技大学071000,求调剂 +4 沿岸有贝壳6 2026-03-21 4/200 2026-03-22 07:21 by ilovexiaobin
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 一志愿南大,0703化学,分数336,求调剂 +3 收到VS 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:42 by 学员8dgXkO
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南昌大学,327分,材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ^O^乜 2026-03-19 7/350 2026-03-20 21:43 by JourneyLucky
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
信息提示
请填处理意见