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cj4566

木虫 (正式写手)

[求助] ONIOM的Error imposing constraints错误

最近用ONIOM对氧化锌cluster优化时总出错,高手出来指点一下吧,谢谢了。
我按照小木虫上的经验,先将体系都设成low层,用分子动力学进行了测试,和分层时候的错误是一样的。我的输入文件:
%chk=5.chk
%mem=1500MB
%nprocs=6
#p opt pm3 iop(5/13=1) test

Zn60O60(100)

0 1
O               -1   -6.56590000    1.62460000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    4.59430000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    4.59430000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    4.59430000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    4.59430000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    6.49850000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000    9.79980000 L
Zn               0   -7.50390000    9.74780000    5.20540000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000    7.19700000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000    5.20540000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000    7.19700000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000    7.19700000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000    7.80820000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000    9.79980000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000    5.20540000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000    7.19700000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000    7.80820000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000    9.79980000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000    7.80820000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000    9.79980000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    0.00000000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    1.62460000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    1.62460000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    1.62460000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    3.24930000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    4.87390000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    3.24930000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    4.87390000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    4.87390000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    3.24930000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    3.24930000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    4.87390000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    4.87390000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    6.49850000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000    8.12320000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    6.49850000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000    8.12320000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000    8.12320000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    6.49850000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    6.49850000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000    8.12320000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000    8.12320000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   10.41090000 L
O               -1   -7.50390000    9.74780000   12.40250000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   10.41090000 L
O                0   -4.68990000   11.37240000   12.40250000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000    9.74780000   12.40250000 L
Zn              -1   -6.56590000   11.37240000   13.01360000 L
O               -1   -6.56590000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -3.75190000    9.74780000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000    9.74780000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   11.37240000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   11.37240000   15.00520000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   10.41090000 L
O                0   -1.87600000   12.99710000   12.40250000 L
Zn               0   -3.75190000   12.99710000   13.01360000 L
O                0   -3.75190000   12.99710000   15.00520000 L
Zn               0   -0.93800000   14.62170000   13.01360000 L
O                0   -0.93800000   14.62170000   15.00520000 L
Zn              -1   -7.50390000    0.00000000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    1.62460000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    3.24930000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    4.87390000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    3.24930000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    6.49850000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000    8.12320000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    6.49850000   15.61630000 L
Zn              -1   -7.50390000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -4.68990000   11.37240000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000    9.74780000   15.61630000 L
Zn               0   -1.87600000   12.99710000   15.61630000 L


输出文件:
New curvilinear step failed, DQL= 7.02D+00 SP=-2.06D-01.
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.07083751 RMS(Int)=  0.16326873
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.01446703 RMS(Int)=  0.10854532
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.01023580 RMS(Int)=  0.15224388
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.01403792 RMS(Int)=  0.13226878
Old curvilinear step not converged, using linear step
OIter  1 Iteration     1 Try  1 RMS(Cart)=  0.00036482 RMS(Int)=  0.00046129
OIter  1 Iteration     2 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001781 RMS(Int)=  0.00048441
OIter  1 Iteration     3 Try  1 RMS(Cart)=  0.00001657 RMS(Int)=  0.00060400
OIter  1 Iteration     4 Try  1 RMS(Cart)=  0.00003574 RMS(Int)=  0.00105301
Old curvilinear step not converged, using linear step
Error imposing constraints
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 12:05:02 2011.
我冻结了部分原子,怀疑是冻结的问题,但是文献也是冻结的,文献优化完的结构几乎没变。

---------------
如果不冻结原子,结构变化很大,不是我想要的了,而且出现下面错误:
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Thu Jun 16 22:37:39 2011.

[ Last edited by cj4566 on 2011-6-16 at 20:41 ]
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cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 冬天里的骄阳 at 2011-06-17 10:31:28:
参考文献J. Phys. Chem. C, 2009, 113 (4), pp 1474–1485
话说PM3并不是分子动力学吧
你这个结构我优化了一下,没有你说的那个错误

太感激了,很奇怪为什么我按上面的计算会有那错误。我就是找上面的哪文献做的,今天发现结构有点不一样,然后改过来按文献方法又算了,出现 Error in internal coordinate system.错误。这次的输入文件:
%chk=01.chk
%mem=2000MB
%nprocs=6
#p opt oniom(b3lyp/lanl2dz:pm3) iop(5/13=1) test

ZnO (-1 0 0)

0 1 0 1 0 1
O               -1    4.68990000    1.62460000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    0.00000000    4.59430000 L
Zn              -1    6.56590000    1.62460000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000    1.62460000    7.19700000 L
Zn              -1    4.68990000    1.62460000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000    1.62460000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    0.00000000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    0.00000000    9.79980000 L
Zn              -1    6.56590000    1.62460000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000    1.62460000   12.40250000 L
Zn              -1    4.68990000    1.62460000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000    1.62460000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    0.00000000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    0.00000000   15.00520000 L
Zn              -1    6.56590000    1.62460000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000    3.24930000    4.59430000 L
O               -1    4.68990000    4.87390000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    3.24930000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000    4.87390000    5.20540000 L H 20
O                0    0.93800000    4.87390000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000    3.24930000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000    3.24930000    7.19700000 L
Zn              -1    6.56590000    4.87390000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000    4.87390000    7.19700000 L
Zn              -1    1.87600000    3.24930000    7.80820000 L H 20
O               -1    1.87600000    3.24930000    9.79980000 L H 31
Zn              -1    4.68990000    4.87390000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000    4.87390000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    3.24930000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    3.24930000    9.79980000 L
Zn               0    0.93800000    4.87390000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000    4.87390000   12.40250000 L H 31
Zn              -1    3.75190000    3.24930000   10.41090000 L
O               -1    3.75190000    3.24930000   12.40250000 L
Zn              -1    6.56590000    4.87390000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000    4.87390000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000    3.24930000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000    3.24930000   15.00520000 L
Zn              -1    4.68990000    4.87390000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000    4.87390000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    3.24930000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    3.24930000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000    4.87390000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000    3.24930000   15.61630000 L
Zn              -1    6.56590000    4.87390000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000    6.49850000    4.59430000 L
O               -1    4.68990000    8.12320000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    6.49850000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000    8.12320000    5.20540000 L H 50
O                0    0.93800000    8.12320000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000    6.49850000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000    6.49850000    7.19700000 L H 55
Zn              -1    6.56590000    8.12320000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000    8.12320000    7.19700000 L
Zn               0    1.87600000    6.49850000    7.80820000 H
O                0    1.87600000    6.49850000    9.79980000 H
Zn              -1    4.68990000    8.12320000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000    8.12320000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    6.49850000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    6.49850000    9.79980000 L
Zn               0    0.93800000    8.12320000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000    8.12320000   12.40250000 L H 61
Zn              -1    3.75190000    6.49850000   10.41090000 L H 56
O               -1    3.75190000    6.49850000   12.40250000 L
Zn              -1    6.56590000    8.12320000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000    8.12320000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000    6.49850000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000    6.49850000   15.00520000 L
Zn              -1    4.68990000    8.12320000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000    8.12320000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    6.49850000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    6.49850000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000    8.12320000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000    6.49850000   15.61630000 L
Zn              -1    6.56590000    8.12320000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000    9.74780000    4.59430000 L
O               -1    4.68990000   11.37240000    4.59430000 L
O               -1    7.50390000    9.74780000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000   11.37240000    5.20540000 L H 80
O                0    0.93800000   11.37240000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000    9.74780000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000    9.74780000    7.19700000 L H 85
Zn              -1    6.56590000   11.37240000    5.20540000 L
O               -1    6.56590000   11.37240000    7.19700000 L
Zn               0    1.87600000    9.74780000    7.80820000 H
O                0    1.87600000    9.74780000    9.79980000 H
Zn              -1    4.68990000   11.37240000    7.80820000 L
O               -1    4.68990000   11.37240000    9.79980000 L
Zn              -1    7.50390000    9.74780000    7.80820000 L
O               -1    7.50390000    9.74780000    9.79980000 L
Zn               0    0.93800000   11.37240000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000   11.37240000   12.40250000 L H 91
Zn              -1    3.75190000    9.74780000   10.41090000 L H 86
O               -1    3.75190000    9.74780000   12.40250000 L
Zn              -1    6.56590000   11.37240000   10.41090000 L
O               -1    6.56590000   11.37240000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000    9.74780000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000    9.74780000   15.00520000 L
Zn              -1    4.68990000   11.37240000   13.01360000 L
O               -1    4.68990000   11.37240000   15.00520000 L
Zn              -1    7.50390000    9.74780000   13.01360000 L
O               -1    7.50390000    9.74780000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000   11.37240000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000    9.74780000   15.61630000 L
Zn              -1    6.56590000   11.37240000   15.61630000 L
O               -1    1.87600000   12.99710000    4.59430000 L
Zn              -1    0.93800000   14.62170000    5.20540000 L H 108
O                0    0.93800000   14.62170000    7.19700000 H
Zn              -1    3.75190000   12.99710000    5.20540000 L
O               -1    3.75190000   12.99710000    7.19700000 L H 111
Zn               0    1.87600000   12.99710000    7.80820000 H
O                0    1.87600000   12.99710000    9.79980000 H
Zn               0    0.93800000   14.62170000   10.41090000 H
O               -1    0.93800000   14.62170000   12.40250000 L H 113
Zn              -1    3.75190000   12.99710000   10.41090000 L H 112
O               -1    3.75190000   12.99710000   12.40250000 L
Zn              -1    1.87600000   12.99710000   13.01360000 L
O               -1    1.87600000   12.99710000   15.00520000 L
Zn              -1    0.93800000   14.62170000   15.61630000 L
Zn              -1    3.75190000   12.99710000   15.61630000 L

输出文件:
Error in internal coordinate system.
Error termination via Lnk1e in /pkg/suse11/gaussian/g09/l103.exe at Fri Jun 17 10:49:22 2011.
这是什么原因呢?谢谢了
我是高斯纯新手,PM3是什么都没查,不好意思啊,以为oniom的low层都用分子动力学。
5楼2011-06-17 11:08:29
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查看全部 7 个回答

cj4566

木虫 (正式写手)

怎么没人回答呢?
2楼2011-06-17 07:09:13
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cj4566(金币+10): 谢谢! 2011-06-17 11:10:36
参考文献J. Phys. Chem. C, 2009, 113 (4), pp 1474–1485
话说PM3并不是分子动力学吧
你这个结构我优化了一下,没有你说的那个错误
3楼2011-06-17 10:31:28
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冬天里的骄阳

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

补充:
lz的冻结选择并不好,起码我按照你给定的格式优化,结构变化很大,按参考文献再认真选择合适的冻结原子吧
4楼2011-06-17 10:34:02
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