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汕头大学海洋科学接受调剂
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tingspdf

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 各位同仁都用什么软件计算DNA双链的分子量?

如题。要求能计算长链DNA(>1kb)的分子量
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gwbk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-06-14 18:57:01
tingspdf(金币+4): 2011-06-14 19:39:21
BIOEditDNA molecule: pKK223-3
Length = 4584 base pairs
Molecular Weight = 1395813.00 Daltons, single stranded
Molecular Weight = 2789506.00 Daltons, double stranded
G+C content = 53.66%
A+T content = 46.34%

Nucleotide  Number   Mol%
    A        1042    22.73
    C        1269    27.68
    G        1191    25.98
    T        1082    23.60
4楼2011-06-14 18:49:30
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beautybanana

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-06-14 18:56:54
tingspdf(金币+1): 这种还是不太精确,呵呵,不过还是谢谢 2011-06-14 19:39:13
这个还要用软件计算吗?
平均分子量:
dsDNA=(碱基数) x (660 道尔顿/碱基)
ssDNA=(碱基数) x (330 道尔顿/碱基)
ssRNA=(碱基数) x (340 道尔顿/碱基)
3楼2011-06-14 16:47:13
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gwbk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
amisking(金币+3): 鼓励应助 2011-06-14 18:57:12
tingspdf(金币+5): 2011-06-14 19:39:24
具体操作是:
BIOEdit打开序列
依次点:
Sequence
Nucleic Acid
Nucleotide Composition
即可得到如楼上描述。
5楼2011-06-14 18:55:10
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