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astringent

铜虫 (著名写手)

[求助] 请问你什么是ab initio md

请问大家有了解ab intito MD simulation的吗?有个教授问我,可是我不懂啊?请大家指点,多谢

[ Last edited by ghcacj on 2011-6-14 at 09:59 ]
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舞昂琦VoVo

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
astringent(金币+10): 2011-06-14 15:47:08
ghcacj(金币+6): 谢谢 2011-06-14 17:47:30
首先,分子动力学MD的基本原理是应用牛顿运动定律模拟各原子的运动,各原子间的相互作用是采用势函数模拟。其中,势函数可以采用经验势函数,这也是较为基础的模拟所采用的;也可以不借助经验参数,从量子力学的角度出发,通过模拟各个电子间的相互作用来描述原子间的相互作用,这也就是ab initio从头算的意义,精度高,但是只能用于计算比较小的体系。现在第一性原理辅助构建势函数的方法也应用比较广泛。一己之浅见,希望有大家来批评纠正~
我不想停止
2楼2011-06-14 09:59:41
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-06-15 09:40:52
对做实验的人讲呢,就说ab initio MD是相对于classical MD经典动力学模拟而言的,这个ab inito MD模拟过程中是考虑电子传递和极化效应的。所以能够模拟化学反应过程,或者与电子传递,输运,磁场响应有关的材料性质。
3楼2011-06-15 03:28:00
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ChemiAndy

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
astringent(金币+10): 2011-06-15 05:11:11
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-06-15 09:41:00
引用回帖:
Originally posted by ChemiAndy at 2011-06-15 03:28:00:
对做实验的人讲呢,就说ab initio MD是相对于classical MD经典动力学模拟而言的,这个ab inito MD模拟过程中是考虑电子传递和极化效应的。所以能够模拟化学反应过程,或者与电子传递,输运,磁场响应有关的材料性 ...

如果要进一步解释MD模拟呢,就是二楼说的,通过建立一个理想模型体系,模拟真实分子和原子的相互作用和运动,从而观测了解过程的原子细节,或者求取体系、材料的性质。

但是,模拟都是有的缺陷。主要有2点,一个是关于分子和原子间相互作用的模拟,或者基于经典分子力学,或者基于电子结构计算方法,它们都只具有一定的精度;二是模拟方法,比如,体系的理想性,体系的空间尺度和时间尺度,比如能量守恒等等。

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4楼2011-06-15 03:42:59
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舞昂琦VoVo

木虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by ChemiAndy at 2011-06-15 03:42:59:
如果要进一步解释MD模拟呢,就是二楼说的,通过建立一个理想模型体系,模拟真实分子和原子的相互作用和运动,从而观测了解过程的原子细节,或者求取体系、材料的性质。

但是,模拟都是有的缺陷。主要有2点, ...

多谢精彩的补充~~
我不想停止
5楼2011-06-16 10:46:31
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rizen

金虫 (著名写手)

可否说,经典MD和ab initio MD,仅是MD是否考虑采用经验参数或势函数的区别?? 经典的MD的势函数是经验得来的或者拟合来的,而ab initio MD的“势函数”是基于电子结构的量子力学的原理来计算的??
6楼2012-09-23 20:08:33
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wegreen

银虫 (小有名气)

好问题,学习了
7楼2014-10-14 05:01:01
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smutao

禁虫 (著名写手)

送红花一朵
本帖内容被屏蔽

8楼2014-10-14 05:06:56
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petrowoman

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by ChemiAndy at 2011-06-15 03:42:59
如果要进一步解释MD模拟呢,就是二楼说的,通过建立一个理想模型体系,模拟真实分子和原子的相互作用和运动,从而观测了解过程的原子细节,或者求取体系、材料的性质。

但是,模拟都是有的缺陷。主要有2点,一个 ...

感谢!!!
9楼2014-11-15 16:51:46
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