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舞昂琦VoVo木虫 (小有名气)
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[求助]
求助ab initio MD中SMASS设置及并行问题
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最近在做一个ab initio MD，在选择nvt系综进行模拟的过程中，出现几个小问题，求助各位： 1. 在进行参数设置时，有个跟温控相关的参数是Nose mass，我查了手册，说是最好设置得跟体系典型声子频率相当。那我在设置的时候，是必须查文献or手册确定体系的声子频率（我也确定是否有相应的资料），还是可以根据某些经验规则预估一个，又或者可以随意设置一个，对结果影响不大呢？ 我先随便设置了一个SMASS=1，结果显示： SMASS = 1.00 Nose mass-parameter (am) estimated Nose-frequenzy (Omega) = 0.67E+14 period in steps = 23.35 mass= 0.878E-27a.u. 不知道这样的结果合适么？ 2. 在并行MD跑到一定步数之后，程序就会出一个Warning：Sub-Space-Matrix is not Hermitian in DAV，每步都出，相当讨厌，不知道这个警告对结果影响大么？而且这跟哪些参数有关，如何设置才能避免这个Warning呢？ 求助各位高手，多谢多谢！！ |
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