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舞昂琦VoVo

木虫 (小有名气)

[求助] 求助ab initio MD中SMASS设置及并行问题

最近在做一个ab initio MD,在选择nvt系综进行模拟的过程中,出现几个小问题,求助各位:
1. 在进行参数设置时,有个跟温控相关的参数是Nose mass,我查了手册,说是最好设置得跟体系典型声子频率相当。那我在设置的时候,是必须查文献or手册确定体系的声子频率(我也确定是否有相应的资料),还是可以根据某些经验规则预估一个,又或者可以随意设置一个,对结果影响不大呢?
我先随便设置了一个SMASS=1,结果显示:
SMASS  =   1.00    Nose mass-parameter (am)                                                
estimated Nose-frequenzy (Omega)   =  0.67E+14 period in steps = 23.35 mass=   0.878E-27a.u.
不知道这样的结果合适么?

2. 在并行MD跑到一定步数之后,程序就会出一个Warning:Sub-Space-Matrix is not Hermitian in DAV,每步都出,相当讨厌,不知道这个警告对结果影响大么?而且这跟哪些参数有关,如何设置才能避免这个Warning呢?

求助各位高手,多谢多谢!!
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我不想停止
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舞昂琦VoVo

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gavinliu7390 at 2013-04-08 21:24:12
1, 没有什么问题。
2, IALGO=48

您好,感谢您的回复,我重新改了一下IALGO的设置。还想再请教一个问题,我在nvt模拟的时候温度起伏有时会比较大,偶尔还能达到1000度的上下起伏,不知道正常情况下温度起伏应该在多大呢?我之前一直认为跟SMASS设置地不好有关,不知道还有没有其他因素会影响这个呢。谢谢了。
我不想停止
3楼2013-04-09 19:07:40
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
舞昂琦VoVo: 金币+4, ★★★很有帮助 2013-04-09 16:48:55
1, 没有什么问题。
2, IALGO=48
真理是一点点接近的!
2楼2013-04-08 21:24:12
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gavinliu7390

木虫 (著名写手)

叶落鹰飞

【答案】应助回帖

nvt欺负很大很正常。 跟smass无关。  主要是你模拟的时间比较短, 或者温度比较高。 模拟时间更长一点,温度震荡会逐渐减小。
真理是一点点接近的!
4楼2013-04-10 09:48:57
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