[交流] MS生成的石墨烯和纳米管导出后使用vmd的问题 已有2人参与

各位兄弟，我使用MS建了纳米管和石墨烯，并且已经将石墨烯和纳米管结合，在纳米管和石墨烯结合时删掉了石墨烯适当的原子，导出文件时pdb格式的，使用vmd加载时可以成功加载，可是生成psf文件时，vmd出了问题： 而且我在直接双击导出的pdb文件，也是打不开的： 没办法了，我只有先加载导出的pdb文件，然后生成了一个pdb文件，并命名为1.pdb，当我使用graph.pdb再生成psf文件时，又出现了问题： 生成psf文件我是这样写的pgn文件： package require psfgen topology top_all27_prot_lipid.inp pdbalias residue HIS HSE pdbalias atom ILE CD1 CD segment U {pdb graph.pdb} coordpdb graph.pdb U guesscoord writepdb graphi.pdb writepsf graphi.psf 各位兄弟，帮我分析一下吧，我能力有限，期待兄弟们的回复，先谢谢了。

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