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jihuasong

铁虫 (初入文坛)

[求助] 引物设计~ 急求~

TTGGCAGAAATCATCAGAAGTCACAGCGGACTCCGCAGAAGACACCGTCACGAGTCGGGTAGCAGTAAGGAGTGCATTTAGGTGCACGCTTCTTCCTGATGTTAAACAGCCTCTTCCCCAATTCTACTGGCAACTCTTGATGATCAGCAACTGGATCATCACTGCTCACTAACTCCACCAGCTCTTCTACTCCAGTGACGGGTAAGGCAGAGCTCTCCTGAGTGCAAATGAGGGCGAGCACGACGGCCACTGCAACTGCAACACTGAATGTCTTCATCTTAGGAGGGTTGAAGTGGTTTAGTTGGATCGGATCCCCGGGTACCGAGCTCGAATTCACTGGCCGTCGTTTTACAACGTCGTGACTGGGAAAACCCTGGCGTTACCCAACTTAATCGCCTTGCAGCACATCCCCCTTTCGCCAGCTGGCGTAATAGCGAAGAGGCCCGCACCGAT

  各位大侠~ 小弟最近设计引物做RACE~ 但越设越糊涂, 搞得现在毫无头绪了,请教各位大侠要怎么设计引物来扩以上给出的序列?  不要求您设的引物可以用, 我只是想学习下方法, 您可以只从两端设一对引物即可~
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命运掌握在自已手中
1楼 2011-06-03 15:37:11
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kidtt

新虫 (初入文坛)
★ ★
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-06-03 23:09:00
race的话，5'race是在你已有的这段序列里设计一组下游引物，一般race要多次扩增，一次PCR出不来，要做巢式PCR，所以设计的下游引物，每个引物间要有重叠，上游是用通用引物。3'race就在这段序列里设计上游引物，下游用通用引物。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2011-06-03 15:51:38
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jihuasong

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by kidtt at 2011-06-03 15:51:38:
race的话，5'race是在你已有的这段序列里设计一组下游引物，一般race要多次扩增，一次PCR出不来，要做巢式PCR，所以设计的下游引物，每个引物间要有重叠，上游是用通用引物。3'race就在这段序列里设计上游引物，下 ...

那这位大侠~ 可以根据以上这个序列示范一下嘛~?  
比如设计一下5`RACE的下游引物和3`RACE的上游引物~  
  我想知道要怎么下手, 比如上游引物,下游引物应该处于序列的什么位置~  
  然后哪个需要相当序列~ 哪个需要互补序列~ 这些我都还不知道呢~
  所以希望大侠能示范一次~ 嘿嘿~  不甚感激啊!
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命运掌握在自已手中
3楼2011-06-03 22:59:25
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linqin1029

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

jihuasong(金币+2): 谢谢! 2011-07-18 19:39:18
3'race-outer:TAGTTGGATCGGATCCCCGGGTACC
3'race-inner:GGGTACCGAGCTCGAATTCACTGGC
5'race-outer:CAGTTGCTGATCATCAAGAGTTGCC
5'race-inner:TTGCCAGTAGAATTGGGGAAGAGGC
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4楼2011-06-17 09:13:17
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