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kf_zhl

铜虫 (初入文坛)

[求助] 动力学跑NPT时如何得到比体积与时间的关系图?

我想用MS模拟高分子链的玻璃化转变温度,请问在做动力学跑NPT时如何得到比体积与时间的关系图?默认的是出来温度、能量与时间的关系,那体积的能得到吗?
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wl1258

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
kf_zhl(金币+5): 2011-06-08 09:38:19
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-06-08 16:18:47
想法很强大,不过那样会不会点太多了点?可以手动的具体到某一帧上取体积,再作图
人生苦短,学不可怠
2楼2011-06-04 22:09:00
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meixinqing

金虫 (著名写手)

梅心晴|一只蘑菇

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2011-06-05 12:20:15
kf_zhl(金币+5): 2011-06-08 09:42:58
看你用什么代码吧
就我知道 一个叫做moldy的代码 如果跑NPT的计算 得到的输出文件中V是个变量(时间的函数),每步也有对应的能量之类,不知道是不是能够得到你想要的信息
由于诡异的原因msn偶尔上不去,由于众所周知的原因qq基本不登陆,私聊的pmgmail地址加gtalk/*emuch是个很好很和谐的论坛*/
3楼2011-06-04 23:33:10
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kf_zhl

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by wl1258 at 2011-06-04 22:09:00:
想法很强大,不过那样会不会点太多了点?可以手动的具体到某一帧上取体积,再作图

好像工作量挺大的,我从.out文件中看到体积值了 还是谢谢了
4楼2011-06-08 09:41:59
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kf_zhl

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by meixinqing at 2011-06-04 23:33:10:
看你用什么代码吧
就我知道 一个叫做moldy的代码 如果跑NPT的计算 得到的输出文件中V是个变量(时间的函数),每步也有对应的能量之类,不知道是不是能够得到你想要的信息

我也不知道什么代码 好像V随着时间会趋于稳定的吧?我从NPT输出的.out文件看到了体积值 但是没有变化趋势
5楼2011-06-08 09:45:23
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meixinqing

金虫 (著名写手)

梅心晴|一只蘑菇

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-06-08 16:19:34
引用回帖:
Originally posted by kf_zhl at 2011-06-08 09:45:23:
我也不知道什么代码 好像V随着时间会趋于稳定的吧?我从NPT输出的.out文件看到了体积值 但是没有变化趋势

根据我的经验是:
如果是npt 那么体积会变
nvt 压力会变

随着时间都会趋于稳定 但是还是会在一定范围内波动

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由于诡异的原因msn偶尔上不去,由于众所周知的原因qq基本不登陆,私聊的pmgmail地址加gtalk/*emuch是个很好很和谐的论坛*/
6楼2011-06-08 11:14:33
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kf_zhl

铜虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by meixinqing at 2011-06-08 11:14:33:
根据我的经验是:
如果是npt 那么体积会变
nvt 压力会变

随着时间都会趋于稳定 但是还是会在一定范围内波动

好的~谢谢啦
7楼2011-06-09 10:40:12
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fm840301

新虫 (初入文坛)

楼主你好,我也在做和你一样的工作,能交流下吗?你的问题得到解决了吗?
8楼2011-08-25 17:07:16
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lorna639

木虫 (著名写手)

引用回帖:
594054楼: Originally posted by kf_zhl at 2011-06-01 15:32:46
我想用MS模拟高分子链的玻璃化转变温度,请问在做动力学跑NPT时如何得到比体积与时间的关系图?默认的是出来温度、能量与时间的关系,那体积的能得到吗?

"动力学跑NPT时如何得到比体积与时间的关系图",我也遇到了同样的问题,请问你是如何解决的,可以交流一下么?多谢~。
9楼2012-06-18 09:54:48
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mimizong

新虫 (小有名气)

感兴趣+1
10楼2012-06-19 18:58:30
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