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biofeixue

木虫 (著名写手)

[求助] DEPC水配制及用器烘问题?

  DEPC水能不能在用前提前三天,按比例在双蒸水中加入DEPC,不搅拌,让它溶上三天,等看不到DEPC油滴后再用,这种方法效果好吗?用前再灭菌,能把RNAase 灭活吗?
  用0.1%的DEPC水泡过的枪头后,把盛枪头的瓶子中的水倒干净,但有时很全部倒干净,因为怕DEPC水有毒,最后,在灭菌后总是看到里面还有一些水,请问我能不能在烘干时,把瓶口包有报纸的瓶子倒过来烘干?
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
biofeixue(金币+5): 请问你是怎么配DEPC的?要每提一次RNA就配一次吗?另外若烘2天不会有细菌进去吧? 2011-05-30 05:46:36
dhd997(金币+5, EPI+1): 2011-05-30 08:26:55
引用回帖:
Originally posted by biofeixue at 2011-05-30 03:13:52:
  DEPC水能不能在用前提前三天,按比例在双蒸水中加入DEPC,不搅拌,让它溶上三天,等看不到DEPC油滴后再用,这种方法效果好吗?用前再灭菌,能把RNAase 灭活吗?
  用0.1%的DEPC水泡过的枪头后,把盛枪头的 ...

DEPC即diethyl pyrocarbonate。分子式为C6H10O5,分子量为162.14,无色、澄清透明的液体。是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
DEPC不稳定,在水溶液中会分解成乙醇和二氧化碳, 25℃、磷酸缓冲液中其半衰期为4 min(pH 6)、9 min(pH 7)。在水中的半衰期约为30min。

这个别说你提前让它溶上3天,提前溶3小时都值得商榷。但是经典实验手册上都是说浸泡过夜或12小时的。。。。这个确实有点小不理解

使用前高温降解DEPC。。。。这个问题不大,但是实际情况是即使你水倒的很干,灭完在60℃烘干也要2天左右才能彻底干。

水会把纸弄湿,外界RNase有机会污染
PS:但凡你自己觉得试验有问题的话,基本上它就是真的有问题。做一个严格的实验,真的很难。
2楼2011-05-30 04:48:26
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普通回帖

biofeixue

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by cdl007 at 2011-05-30 04:48:26:
DEPC即diethyl pyrocarbonate。分子式为C6H10O5,分子量为162.14,无色、澄清透明的液体。是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
DE ...

我们这儿大家都用DEPC水泡EP管很多次。多次重复使用,你们泡EP管的DEPC水都是现配现用吗?请问你是怎么配的?
3楼2011-05-30 05:56:23
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cdl007

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


1949stone(金币+1): 继续鼓励 2011-05-30 16:32:21
biofeixue(金币+2): 2011-06-07 08:15:56
参见分子克隆第三版

我是depc加进去就用搅拌子转,同时泡枪尖和管

菌是不怕的,怕的是RNas。

没灭过菌吗?灭菌也是用东西包着啊,一个不进去不可能,但是可以尽量减少外界污染的机会
4楼2011-05-30 10:42:27
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忘忧草_

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
biofeixue(金币+3): 2011-06-07 08:16:19
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-08-15 11:17:28
其实没那么严重,我一般做的都是DEPC水配好,搅拌10min,将枪头、ep管等泡在里面,置30℃,黑暗条件下,12 h;取出高压灭菌,烘干即可,没大问题。楼主嫌麻烦可以直接定购无RNase的枪头
不将就
5楼2011-06-01 13:48:32
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~AWA~

银虫 (小有名气)

想弱弱的问一句,枪头是泡完DEPC水之后装盒子里,还是说高压灭菌后再无菌条件下装盒子里呢?????
6楼2011-06-08 12:42:04
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cdl007

木虫 (正式写手)

7楼2011-06-08 17:09:11
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cloverplm

金虫 (小有名气)

★ ★ ★
1949stone(金币+3): 提醒到位 2011-08-15 11:17:53
引用回帖:
Originally posted by ~AWA~ at 2011-06-08 12:42:04:
想弱弱的问一句,枪头是泡完DEPC水之后装盒子里,还是说高压灭菌后再无菌条件下装盒子里呢?????

最好选择泡完后再装了灭,泡完之后装也要注意,还是要在无RNA酶的环境中。泡的过程要在通风橱中进行,一般过夜泡,那个泡完剩的水你可以收集起来,用来以后擦拭提RNA的超净工作台台面。PS:DEPC神经毒性的哦,一定要戴好口罩。偶以前常做这个。其实最方便的就是买现成的不用泡的无RNA酶的Ep管。
净——静——竞——进
8楼2011-07-25 20:41:59
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256k

新虫 (正式写手)

小疑问:在RT-PCR中,在大烧杯里DEPC浸泡枪头后拿去灭菌,要是用牛皮纸什么的封口,纸上的RNA酶怎么处理?这不是等于白处理了?
9楼2011-08-15 10:26:49
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256k

新虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by cloverplm at 2011-07-25 20:41:59:
最好选择泡完后再装了灭,泡完之后装也要注意,还是要在无RNA酶的环境中。泡的过程要在通风橱中进行,一般过夜泡,那个泡完剩的水你可以收集起来,用来以后擦拭提RNA的超净工作台台面。PS:DEPC神经毒性的哦,一 ...

这样的DEPC没分解,擦台面会对人体有毒;要是高压灭菌后的就分解了,起不到抑制RNA酶的作用,这不是一个矛盾么?
10楼2011-08-15 10:29:31
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