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[求助]
做过RNAi或者实时定量的同学请帮助我解决一个问题,感激不尽
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最近在做RNAi,我的实验对象是秀丽隐杆线虫,采用的干扰方式是浸泡,将体外转录获得的dsRNA通过浸泡的方式导入线虫体内,收集虫体后提取总RNA,反转录成cDNA之后做实时定量检测干扰效果。可定量结果让我很头疼,目的基因的拷贝数不仅没有降低,反而升高了。如果说目的基因的拷贝数没有明显下降,可以解释为干扰效果不好,但是目的基因的拷贝数明显上升,这怎么解释?希望高手可以帮我解释一下这个现象,感激不尽~~~ 我个人认为,可能是浸泡后的虫体内残留有dsRNA,是不是因为在进行总RNA提取和反转录的时候将残留的dsRNA也一并提出并合成了cDNA,从而导致目的基因的拷贝数增加?如果这种推测成立,那么,在提取总RNA之前应该怎样对虫体进行处理,以消除dsRNA的干扰? 我做的是相对定量,每次都做三个重复,以管家基因的拷贝数作为标准,计算目的基因的相对含量,可是实验组的目的基因含量每次都比阴性对照组高。另外,我本次干扰一共做了三个不同的基因,貌似三个不同的基因都出现了这样的情况,让人很费解,求帮助~~~ [ Last edited by 1949stone on 2011-5-30 at 16:24 ] |
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