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1900bp的一个属的细菌的片段用哪个什么方法可以直接测通
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dingjunrong
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1900bp的一个属的细菌的片段用哪个什么方法可以直接测通
我用PCR扩增了一个属的保守片段,其中每个种的碱基会有不同,大约1900bp,用什么测序方法可以直接测我的PCR产物中1900bp的不同序列,从而鉴定其中的种,而不需要做基因文库~
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1楼
2011-05-25 16:12:22
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dingjunrong
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引用回帖:
Originally posted by
poog502
at 2011-05-26 11:50:30:
既然是特异引物扩增的,怎么说是混合的?是不是你把不同的种的样品混合,然后扩增得到的特异条带。等等,扩增出现了几条带?可以分开回收条带,分别交给公司直接测序。
我提取原样品的总细菌DNA,扩增了一个属的特异性片段,不同种间片段大小相同,碱基不同,电泳条带不能分开的啊~
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人生如戏~戏如人生
11楼
2011-05-26 14:47:21
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cdl007
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★ ★ ★ ★
dingjunrong(金币+5): 2011-05-25 22:12:35
西瓜(金币+4, EPI+1): Good 2011-05-26 12:45:51
引用回帖:
Originally posted by
dingjunrong
at 2011-05-25 16:12:22:
我用PCR扩增了一个属的保守片段,其中每个种的碱基会有不同,大约1900bp,用什么测序方法可以直接测我的PCR产物中1900bp的不同序列,从而鉴定其中的种,而不需要做基因文库~
测序保真度800bp左右,
1900bp分成3段600bp~800bp,6对引物pcr 3段产物,测完拼接
2段pcr,1000bp左右,双向测通也行,也要拼接一下
这个没啥难度,跟测序公司说就行,他们有这个服务的,收费也不高,就个引物的钱
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2楼
2011-05-25 20:18:21
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dingjunrong
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Originally posted by
cdl007
at 2011-05-25 20:18:21:
测序保真度800bp左右,
1900bp分成3段600bp~800bp,6对引物pcr 3段产物,测完拼接
2段pcr,1000bp左右,双向测通也行,也要拼接一下
这个没啥难度,跟测序公司说就行,他们有这个服务的,收费也不高,就 ...
我这个是一个属的混合片段,可以直接测吗?虽然扩出来产物都是1900bp,但是这个PCR产物是不同种的混合片段,不是一种片段,要怎么测,用你说的方法可以吗?
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人生如戏~戏如人生
3楼
2011-05-25 22:15:02
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poog502
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你这个混合片段是怎么得到的?有特异引物吗?有引物的话就可以让测序公司测通即可。但你的混合属的片段是怎么搞的,测出来不知道是哪个物种的。
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4楼
2011-05-25 22:45:15
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