应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 最复杂情况下的参数优化
121/2返回列表12下一页
查看: 2386  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 2 个 1ST强帖 ，点击这里进行查看

navyzhang

木虫 (正式写手)

[求助] 最复杂情况下的参数优化

看了侯老师的VASP教程，关于晶格参数优化存在一些疑问！
对于a,b,c都不相等的体系，是不是可以这样
1、先优化形状(即c/a,b/a)和位置，(将该计算得到的CONTCAR作为下一步的POSCAR)
2、仅优化位置，得到该情况下的能量E1
3、改变a参数，按上面两步，先优化形状和位置，再单优化位置，得到该情况下的能量E2
4、如此往复共改变十次a参数，得到是个能量E1~E10，拟合E-V曲线，得到能量最低时的V0
那么下面参数a到底该怎么求呢？将V0/(b*c)？如果是这样，b和c从哪里来？是能量最低情况下第一步对应的结果？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一原理资料汇编 计算-vasp 分子模拟专题 vasp从结构优化到光学性质

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-25 12:07:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiqi2926

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
youzhizhe(金币+3): 谢谢交流。 2011-05-26 12:27:49
youzhizhe(1ST强帖+1): 谢谢交流。 2011-05-26 16:41:46
首先，结构优化是为了寻找晶体的基态。
在侯博士的那片文章中提到的对复杂晶体的优化，再脚本中的a首先是在实验值的左右各取若干个，然后对晶格采用固定体积的方法进行优化，这样就会得到一系列的a-E图像，做出曲线，这样的话，你就能看到这个曲线呈现U型。我们知道基态的能量应该是最低的，所以a的取值应该是对应于E最小的a，但是一次并不能精确的确定a的值，只能错略的估计a的范围，但是通过多次的缩小这个区间，就能得到较为准确的a值，而由于是允许晶格形可变，且原子位置驰豫的，所以就可以得到基态结构。
赞一下(3人) 回复此楼
2楼2011-05-26 11:37:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

navyzhang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by qiqi2926 at 2011-05-26 11:37:46:
首先，结构优化是为了寻找晶体的基态。
在侯博士的那片文章中提到的对复杂晶体的优化，再脚本中的a首先是在实验值的左右各取若干个，然后对晶格采用固定体积的方法进行优化，这样就会得到一系列的a-E图像，做出曲 ...

不是说要用Birch-MurnaghanG方程拟合E-V曲线得到最低能量状态下的体积吗？
这样得到的a值不一定对吧？b和c都没有考虑进去哇。
如果是最简单的a*a*a晶胞可以这样优化
赞一下 回复此楼
3楼2011-05-26 15:17:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiqi2926

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-05-26 16:39:04
navyzhang(金币+2): 2011-06-02 15:59:24
引用回帖:
Originally posted by navyzhang at 2011-05-26 15:17:14:
不是说要用Birch-MurnaghanG方程拟合E-V曲线得到最低能量状态下的体积吗？
这样得到的a值不一定对吧？b和c都没有考虑进去哇。
如果是最简单的a*a*a晶胞可以这样优化

这个脚本不是所有体系都适合的。。。。所以得自己琢磨一下。我自己推过状态方程，最后可以用matlab拟合，结果还听不错的。。。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-05-26 15:28:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tider

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-05-26 19:23:16
navyzhang(金币+2): 2011-06-02 15:59:36
navyzhang(金币+6): 2011-06-08 08:42:34
我是先ＩＳＩＦ＝４弛豫找到能量最低点后，再把那个ＣＯＮＴＣＡＲ复制到ＰＯＳＣＡＲ里进行ＩＳＩＦ＝３的全弛豫
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2011-05-26 18:47:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nicolemikeyi

禁虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gzqdyouxia(金币+3, 1ST强帖+1): 谢谢详细指教 2011-05-27 10:43:47
那里头的脚本分为两部分，一部分是固定晶胞体积的弛豫，得到CONTCAR后复制到POSCAR中进行另一部分静态计算，得出能量。所以侯的优化思路是这样的：
1.取不同的a值，首先进行ISIF=5的固定体积但不固定形状的弛豫，然后静态计算出对应的能量。
2.每一个a值对应一个体积和能量，多个a值可以得到一条E~V曲线，通过拟合可以得到最小的那个E对应的体积和a值。
3.注意，此时如果是立方晶格，a值即为优化结果。但例如是四方或其他，此时你只是得到了最佳的形状（a/c值），你再取不同的a进行下一次循环，以得到最佳的a值与c值。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

洋洋1984
6楼2011-05-26 20:21:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nicolemikeyi

禁虫 (著名写手)
navyzhang(金币+10): 谢谢 2011-06-02 15:58:59
本帖内容被屏蔽
7楼2011-05-26 20:28:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

navyzhang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by nicolemikeyi at 2011-05-26 20:21:07:
那里头的脚本分为两部分，一部分是固定晶胞体积的弛豫，得到CONTCAR后复制到POSCAR中进行另一部分静态计算，得出能量。所以侯的优化思路是这样的：
1.取不同的a值，首先进行ISIF=5的固定体积但不固定形状的弛豫， ...

状态方程拟合工具你那里有吗？
还望指点！
或者通过origin拟合也可以，方程形式是什么？
赞一下 回复此楼
8楼2011-06-02 15:58:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hiluokun

禁虫 (小有名气)
liliangfang(金币+1): 多谢交流 2012-02-26 08:52:35
本帖内容被屏蔽
9楼2012-02-26 00:16:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

洋洋1984

新虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
350864楼: Originally posted by nicolemikeyi at 2011-05-26 20:21:07:
那里头的脚本分为两部分，一部分是固定晶胞体积的弛豫，得到CONTCAR后复制到POSCAR中进行另一部分静态计算，得出能量。所以侯的优化思路是这样的：
1.取不同的a值，首先进行ISIF=5的固定体积但不固定形状的弛豫， ...

nicolemikeyi 你好，在下有几个问题想请教一下，麻烦了。
1.对于在您的回复：2.每一个a值对应一个体积和能量，多个a值可以得到一条E~V曲线，通过拟合可以得到最小的那个E对应的体积和a值。此处您用的是Birch-Murnaghan方程还是二次曲线拟合的？
2.在结果中得到了a值，但为何是“此时你只是得到了最佳的形状（a/c值）”？如果直接用a/(a/c)是否可以认为得到了c值？你再取不同的a进行下一次循环，以得到最佳的a值与c值？
麻烦指教一下，谢谢！
赞一下 回复此楼
在每一天里，静静地努力，坚韧地积累自己的力量，生活自会走向该去的地方。
10楼2012-05-09 11:24:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 navyzhang 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭