应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 分子动力学计算求助
51/1返回列表
查看: 2396  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

weiwei128

金虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学计算求助

版友们好，我尝试用MD实现模拟退火，计算体系结构变化。遇到了些问题，提示如下：
-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      VASP found    315 degrees of freedom                                   |
|      the temperature will equal 2*E(kin)/ (degrees of freedom)              |
|      this differs from previous releases, where T was 2*E(kin)/(3 NIONS).   |
|      The new definition is more consistent                                  |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------


-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      The distance between some ions is very small                           |
|      please check the nearest neigbor list in the OUTCAR file               |
|          I HOPE YOU KNOW, WHAT YOU ARE  DOING                               |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: wrap around errors must be expected
FFT: planning ...           1
reading WAVECAR
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
       请问这种情况是我的vasp没编译好，还是INCAR的问题？谢谢大家，我的INCAR如下：
     NWRITE =      1                    
   PREC   =      L                    
   ISTART =      0                    
   ICHARG =      2                    
#   ISPIN  =      2                  
#   MAGMOM =  102*1 1*3 2*1         
#  LNONCOLLINEAR = F                  
#  LSORBIT =     F                    
#  INIWAV =      1                    
#  LASPH  =      F                    
#  METAGGA=      F                    
                                      
# Electronic Relaxation 1            
                                      
   ENCUT  =  400.0 eV                 
#  ENINI  =  400.0                    
   NELM   =     60                    
   NELMIN=  4                        
   NELMDL= -4                        
   EDIFF  = 1E-5                     
   LREAL  =     On                    
#  LCOMPAT=      F                    
#  LREAL_COMPAT= F                    
#  GGA_COMPAT  = T                    
#  VOSKOWN=      1                    
#  ROPT   =    0.00000   0.00000   0.0
#  NBANDS =  128                     
#  IALGO  =     38                    
#   GGA=91                           
   ALGO = F                          
#  LDIAG  =      T                    
                                      
# PAW control tag, page 80            
  LMAXPAW = 0                       
  LMAXMIX = 4                        
# ENAUG  =  605.4 eV                  
  ADDGRID = T                        
                                      
# Ionic relaxation                    
   EDIFFG = -0.04                  
   NSW    =   400                     
  NBLOCK =      1                     
  KBLOCK =    100                     
  IBRION =      0                     
  ISIF   =      0                  
  POTIM  =   2                     
  TEBEG  =    297;                    
  TEEND  =   500;                     
  SMASS  =  -1                     
#  PSTRESS=    0.0                    
                                      
#PC function                          
APACO=10                              
#NPACO=200                           
                                      
                                      
                                      
                                      
#   POMASS =  52.00 65.39 16.00      
#   ZVAL   =   6.00 12.00  6.00      
#   RWIGS  =   1.00  1.00  1.00      
#   NUPDOWN=     0 #for AFM?         
                                      
DOS related values:                  
                                      
#   EMIN   = -10.00                  
#   EMAX   =  15                     
#  NEDOS = 800                        
   ISMEAR =    0                     
   SIGMA  =   0.2                     
                                      
                                      
#  Mixing tag  page 73 on manual      
#  IMIX   =      4                    
#   AMIX     =    0.20               
   BMIX     =    2                 #  
#   AMIX_MAG =    0.8                 
#   BMIX_MAG =    0.0001              
   MAXMIX=       50                  
#  AMIN     =    0.10                 
#  WC   =        1000                 
#  INIMIX=       1                    
#  MIXPRE=       1                    
                                      
                                      
# Write flags                        
   LWAVE  =      F                    
   LCHARG =      F                    
#   LORBIT =     12                  
#  LVTOT  =      F                    
#  LELF   =      F                    
                                      
# Monopole, Dipole and Quadruole  corr
#   NELECT =     636.0000            
#  IDIPOL =      4                    
#  LDIPOL =      F                    
                                      
# L(S)DA+U tag                        
# LDAU = T                           
# LDAUTYPE = 2                       
# LDAUL = 2 -1 -1                    
# LDAUU = 2.0 0.0 0                  
# LDAUJ = 0.5 0.0 0                  
# LDAUPRINT = 2                     
#LDAUL LDAUU LDAUJ must be set for eve
# Parallel parameter                  
LPLANE = .TRUE                       
  NPAR = 4                           
  ISYM = 0
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

学习

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-24 10:34:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skplin

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jsheng5059 at 2011-05-24 12:19:08
你这里有两个Warning，第一个可以忽略。但第二个提示原子位置太近了。你需要检查下POSCAR。计算错误可能是原子位置太近造成的。分子动力学一般是IALGO=48.模拟退火时间步长可以取大一些。

第一个为什么不用管啊？都需要退火吗？退火关键的参数是什么？
赞一下 回复此楼
4楼2016-04-22 16:09:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

jsheng5059

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
zhang668(金币+1): 多谢指导 2011-05-24 15:44:24
weiwei128(金币+10): 谢谢 已纠正 2011-05-24 17:14:39
你这里有两个Warning，第一个可以忽略。但第二个提示原子位置太近了。你需要检查下POSCAR。计算错误可能是原子位置太近造成的。分子动力学一般是IALGO=48.模拟退火时间步长可以取大一些。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

skplin
Wair
2楼2011-05-24 12:19:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by weiwei128 at 2011-05-24 10:34:00:
版友们好，我尝试用MD实现模拟退火，计算体系结构变化。遇到了些问题，提示如下：
-----------------------------------------------------------------------------
|                                        ...

最好把POSCAR用VESTA看一下，有没有问题。。。有时很明显的结构不对的
赞一下 回复此楼
timeflies..
3楼2011-05-24 19:04:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 354求调剂 +6 Tyoumou 2026-03-18 9/450 2026-03-21 20:47 by lbsjt
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-20 7/350 2026-03-21 19:05 by 15709483992
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 15/750 2026-03-21 10:16 by 脱颖而出
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 289求调剂 +6 怀瑾握瑜l 2026-03-20 6/300 2026-03-20 20:30 by 学员8dgXkO
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生（接收计算机专业调剂） +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 334求调剂 +3 志存高远意在机� 2026-03-16 3/150 2026-03-18 08:34 by lm4875102
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 11408 一志愿西电，277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油！? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭