应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 分子动力学计算求助
41/1返回列表
查看: 2389  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

weiwei128

金虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学计算求助

版友们好，我尝试用MD实现模拟退火，计算体系结构变化。遇到了些问题，提示如下：
-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      VASP found    315 degrees of freedom                                   |
|      the temperature will equal 2*E(kin)/ (degrees of freedom)              |
|      this differs from previous releases, where T was 2*E(kin)/(3 NIONS).   |
|      The new definition is more consistent                                  |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------


-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      The distance between some ions is very small                           |
|      please check the nearest neigbor list in the OUTCAR file               |
|          I HOPE YOU KNOW, WHAT YOU ARE  DOING                               |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: wrap around errors must be expected
FFT: planning ...           1
reading WAVECAR
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
       请问这种情况是我的vasp没编译好，还是INCAR的问题？谢谢大家，我的INCAR如下：
     NWRITE =      1                    
   PREC   =      L                    
   ISTART =      0                    
   ICHARG =      2                    
#   ISPIN  =      2                  
#   MAGMOM =  102*1 1*3 2*1         
#  LNONCOLLINEAR = F                  
#  LSORBIT =     F                    
#  INIWAV =      1                    
#  LASPH  =      F                    
#  METAGGA=      F                    
                                      
# Electronic Relaxation 1            
                                      
   ENCUT  =  400.0 eV                 
#  ENINI  =  400.0                    
   NELM   =     60                    
   NELMIN=  4                        
   NELMDL= -4                        
   EDIFF  = 1E-5                     
   LREAL  =     On                    
#  LCOMPAT=      F                    
#  LREAL_COMPAT= F                    
#  GGA_COMPAT  = T                    
#  VOSKOWN=      1                    
#  ROPT   =    0.00000   0.00000   0.0
#  NBANDS =  128                     
#  IALGO  =     38                    
#   GGA=91                           
   ALGO = F                          
#  LDIAG  =      T                    
                                      
# PAW control tag, page 80            
  LMAXPAW = 0                       
  LMAXMIX = 4                        
# ENAUG  =  605.4 eV                  
  ADDGRID = T                        
                                      
# Ionic relaxation                    
   EDIFFG = -0.04                  
   NSW    =   400                     
  NBLOCK =      1                     
  KBLOCK =    100                     
  IBRION =      0                     
  ISIF   =      0                  
  POTIM  =   2                     
  TEBEG  =    297;                    
  TEEND  =   500;                     
  SMASS  =  -1                     
#  PSTRESS=    0.0                    
                                      
#PC function                          
APACO=10                              
#NPACO=200                           
                                      
                                      
                                      
                                      
#   POMASS =  52.00 65.39 16.00      
#   ZVAL   =   6.00 12.00  6.00      
#   RWIGS  =   1.00  1.00  1.00      
#   NUPDOWN=     0 #for AFM?         
                                      
DOS related values:                  
                                      
#   EMIN   = -10.00                  
#   EMAX   =  15                     
#  NEDOS = 800                        
   ISMEAR =    0                     
   SIGMA  =   0.2                     
                                      
                                      
#  Mixing tag  page 73 on manual      
#  IMIX   =      4                    
#   AMIX     =    0.20               
   BMIX     =    2                 #  
#   AMIX_MAG =    0.8                 
#   BMIX_MAG =    0.0001              
   MAXMIX=       50                  
#  AMIN     =    0.10                 
#  WC   =        1000                 
#  INIMIX=       1                    
#  MIXPRE=       1                    
                                      
                                      
# Write flags                        
   LWAVE  =      F                    
   LCHARG =      F                    
#   LORBIT =     12                  
#  LVTOT  =      F                    
#  LELF   =      F                    
                                      
# Monopole, Dipole and Quadruole  corr
#   NELECT =     636.0000            
#  IDIPOL =      4                    
#  LDIPOL =      F                    
                                      
# L(S)DA+U tag                        
# LDAU = T                           
# LDAUTYPE = 2                       
# LDAUL = 2 -1 -1                    
# LDAUU = 2.0 0.0 0                  
# LDAUJ = 0.5 0.0 0                  
# LDAUPRINT = 2                     
#LDAUL LDAUU LDAUJ must be set for eve
# Parallel parameter                  
LPLANE = .TRUE                       
  NPAR = 4                           
  ISYM = 0
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

学习

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-24 10:34:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jsheng5059

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
zhang668(金币+1): 多谢指导 2011-05-24 15:44:24
weiwei128(金币+10): 谢谢 已纠正 2011-05-24 17:14:39
你这里有两个Warning，第一个可以忽略。但第二个提示原子位置太近了。你需要检查下POSCAR。计算错误可能是原子位置太近造成的。分子动力学一般是IALGO=48.模拟退火时间步长可以取大一些。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

skplin
Wair
2楼2011-05-24 12:19:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by weiwei128 at 2011-05-24 10:34:00:
版友们好，我尝试用MD实现模拟退火，计算体系结构变化。遇到了些问题，提示如下：
-----------------------------------------------------------------------------
|                                        ...

最好把POSCAR用VESTA看一下，有没有问题。。。有时很明显的结构不对的
赞一下 回复此楼
timeflies..
3楼2011-05-24 19:04:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skplin

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jsheng5059 at 2011-05-24 12:19:08
你这里有两个Warning，第一个可以忽略。但第二个提示原子位置太近了。你需要检查下POSCAR。计算错误可能是原子位置太近造成的。分子动力学一般是IALGO=48.模拟退火时间步长可以取大一些。

第一个为什么不用管啊？都需要退火吗？退火关键的参数是什么？
赞一下 回复此楼
4楼2016-04-22 16:09:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 weiwei128 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 伙伴们，祝我生日快乐吧 +17 myrtle 2026-03-10 26/1300 2026-03-16 18:32 by 青橙Ln
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +12 不知道叫什么！ 2026-03-15 14/700 2026-03-16 16:45 by 我的船我的海
[考研] 283求调剂 +10 小楼。 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 东南大学364求调剂 +4 JasonYuiui 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:36 by Linda Hu
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-15 5/250 2026-03-15 20:38 by Logic2024
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 328，0703考生求调剂，一志愿为东北师范大学 +4 观素律 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:24 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 材料371求调剂 +9 鳄鱼? 2026-03-11 11/550 2026-03-13 22:53 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +9 咪咪空空 2026-03-12 9/450 2026-03-13 22:05 by 星空星月
[考研] 四川大学085601材料工程专硕 初试294求调剂 +4 祝我们好在冬天 2026-03-11 4/200 2026-03-13 21:39 by peike
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +6 柴郡猫_ 2026-03-12 6/300 2026-03-13 20:46 by hmn_wj
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 321求调剂（食品/专硕） +3 xc321 2026-03-12 6/300 2026-03-13 08:45 by xc321
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-12 4/200 2026-03-12 19:33 by 求调剂zz
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭