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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 分子动力学计算求助
南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知（长期有效）
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weiwei128

金虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学计算求助

版友们好，我尝试用MD实现模拟退火，计算体系结构变化。遇到了些问题，提示如下：
-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      VASP found    315 degrees of freedom                                   |
|      the temperature will equal 2*E(kin)/ (degrees of freedom)              |
|      this differs from previous releases, where T was 2*E(kin)/(3 NIONS).   |
|      The new definition is more consistent                                  |
|                                                                             |
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-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|           W    W    AA    RRRRR   N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|           W    W   A  A   R    R  NN   N  II  NN   N  G    G  !!!           |
|           W    W  A    A  R    R  N N  N  II  N N  N  G       !!!           |
|           W WW W  AAAAAA  RRRRR   N  N N  II  N  N N  G  GGG   !            |
|           WW  WW  A    A  R   R   N   NN  II  N   NN  G    G                |
|           W    W  A    A  R    R  N    N  II  N    N   GGGG   !!!           |
|                                                                             |
|      The distance between some ions is very small                           |
|      please check the nearest neigbor list in the OUTCAR file               |
|          I HOPE YOU KNOW, WHAT YOU ARE  DOING                               |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

POSCAR, INCAR and KPOINTS ok, starting setup
WARNING: wrap around errors must be expected
FFT: planning ...           1
reading WAVECAR
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
LAPACK: Routine ZPOTRF failed!           2
       请问这种情况是我的vasp没编译好，还是INCAR的问题？谢谢大家，我的INCAR如下：
     NWRITE =      1                    
   PREC   =      L                    
   ISTART =      0                    
   ICHARG =      2                    
#   ISPIN  =      2                  
#   MAGMOM =  102*1 1*3 2*1         
#  LNONCOLLINEAR = F                  
#  LSORBIT =     F                    
#  INIWAV =      1                    
#  LASPH  =      F                    
#  METAGGA=      F                    
                                      
# Electronic Relaxation 1            
                                      
   ENCUT  =  400.0 eV                 
#  ENINI  =  400.0                    
   NELM   =     60                    
   NELMIN=  4                        
   NELMDL= -4                        
   EDIFF  = 1E-5                     
   LREAL  =     On                    
#  LCOMPAT=      F                    
#  LREAL_COMPAT= F                    
#  GGA_COMPAT  = T                    
#  VOSKOWN=      1                    
#  ROPT   =    0.00000   0.00000   0.0
#  NBANDS =  128                     
#  IALGO  =     38                    
#   GGA=91                           
   ALGO = F                          
#  LDIAG  =      T                    
                                      
# PAW control tag, page 80            
  LMAXPAW = 0                       
  LMAXMIX = 4                        
# ENAUG  =  605.4 eV                  
  ADDGRID = T                        
                                      
# Ionic relaxation                    
   EDIFFG = -0.04                  
   NSW    =   400                     
  NBLOCK =      1                     
  KBLOCK =    100                     
  IBRION =      0                     
  ISIF   =      0                  
  POTIM  =   2                     
  TEBEG  =    297;                    
  TEEND  =   500;                     
  SMASS  =  -1                     
#  PSTRESS=    0.0                    
                                      
#PC function                          
APACO=10                              
#NPACO=200                           
                                      
                                      
                                      
                                      
#   POMASS =  52.00 65.39 16.00      
#   ZVAL   =   6.00 12.00  6.00      
#   RWIGS  =   1.00  1.00  1.00      
#   NUPDOWN=     0 #for AFM?         
                                      
DOS related values:                  
                                      
#   EMIN   = -10.00                  
#   EMAX   =  15                     
#  NEDOS = 800                        
   ISMEAR =    0                     
   SIGMA  =   0.2                     
                                      
                                      
#  Mixing tag  page 73 on manual      
#  IMIX   =      4                    
#   AMIX     =    0.20               
   BMIX     =    2                 #  
#   AMIX_MAG =    0.8                 
#   BMIX_MAG =    0.0001              
   MAXMIX=       50                  
#  AMIN     =    0.10                 
#  WC   =        1000                 
#  INIMIX=       1                    
#  MIXPRE=       1                    
                                      
                                      
# Write flags                        
   LWAVE  =      F                    
   LCHARG =      F                    
#   LORBIT =     12                  
#  LVTOT  =      F                    
#  LELF   =      F                    
                                      
# Monopole, Dipole and Quadruole  corr
#   NELECT =     636.0000            
#  IDIPOL =      4                    
#  LDIPOL =      F                    
                                      
# L(S)DA+U tag                        
# LDAU = T                           
# LDAUTYPE = 2                       
# LDAUL = 2 -1 -1                    
# LDAUU = 2.0 0.0 0                  
# LDAUJ = 0.5 0.0 0                  
# LDAUPRINT = 2                     
#LDAUL LDAUU LDAUJ must be set for eve
# Parallel parameter                  
LPLANE = .TRUE                       
  NPAR = 4                           
  ISYM = 0
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1楼2011-05-24 10:34:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jsheng5059

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
zhang668(金币+1): 多谢指导 2011-05-24 15:44:24
weiwei128(金币+10): 谢谢 已纠正 2011-05-24 17:14:39
你这里有两个Warning，第一个可以忽略。但第二个提示原子位置太近了。你需要检查下POSCAR。计算错误可能是原子位置太近造成的。分子动力学一般是IALGO=48.模拟退火时间步长可以取大一些。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

skplin
Wair
2楼2011-05-24 12:19:08
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enola

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by weiwei128 at 2011-05-24 10:34:00:
版友们好，我尝试用MD实现模拟退火，计算体系结构变化。遇到了些问题，提示如下：
-----------------------------------------------------------------------------
|                                        ...

最好把POSCAR用VESTA看一下，有没有问题。。。有时很明显的结构不对的
赞一下 回复此楼
timeflies..
3楼2011-05-24 19:04:56
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skplin

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jsheng5059 at 2011-05-24 12:19:08
你这里有两个Warning，第一个可以忽略。但第二个提示原子位置太近了。你需要检查下POSCAR。计算错误可能是原子位置太近造成的。分子动力学一般是IALGO=48.模拟退火时间步长可以取大一些。

第一个为什么不用管啊？都需要退火吗？退火关键的参数是什么？
赞一下 回复此楼
4楼2016-04-22 16:09:59
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