24小时热门版块排行榜    

查看: 4622  |  回复: 25

gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

[求助] No initial positions read in

这段时间自学VASP,跑过几个例子,今天照着例子,用自己的体系创建四个输入文件,跑一遍报错 No initial positions read in,论坛搜索了下,说是POSCAR文件有问题,然后改过几次,还是那个报错,现在贴上来给各位看看,初学不懂,欢迎拍砖!
直接帖不上来,超过字符限制了!见附件吧!四个文件都传上来了,还请斧正!

[ Last edited by gmy1990 on 2011-5-23 at 20:06 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

utdwang

银虫 (初入文坛)


gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-09-09 15:52:25
delete the space before 'selective dyanmics' and 'direct'.
Thekeytosuccessinnearlyeverythingisdailyaction
21楼2011-09-09 07:55:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+3): 谢谢,这样我也跑过,但还是报那个错. 2011-05-23 20:04:02
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:32:39
改成这样
ZnBPP-PE
  1
5.664000000000000      -5.664000000000000     -14.228999999999999
0.000000000000000      22.655999999999999       0.000000000000000
23.334319923239100       0.000000000000000       9.288466374673281
H  C N  O  Ti Zn
24 41 4 128 72  1
selective   Dynamics
Cartesian
0.578361   0.718614   0.611128   T T T
0.547221   0.632501   0.531675   T T T
0.682425   0.725486   0.811705   T T T
0.706360   0.639600   0.879079   T T T
0.692803   0.521882   0.870106   T T T
0.681308   0.404317   0.865591   T T T
......
心之所向无惧无悔
5楼2011-05-23 19:40:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blablablu

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
23楼: Originally posted by 用户名zxj at 2015-06-16 16:47:58
同问,解决办法,感谢分享!

delete the space before 'selective dyanmics' and 'direct'.
25楼2016-02-13 20:44:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

enola

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+2): 谢谢,这样试过,还是不行。 2011-05-23 20:03:28
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:31:57
引用回帖:
Originally posted by gmy1990 at 2011-05-23 16:33:24:
这段时间自学VASP,跑过几个例子,今天照着例子,用自己的体系创建四个输入文件,跑一遍报错 No initial positions read in,论坛搜索了下,说是POSCAR文件有问题,然后改过几次,还是那个报错,现在贴上来给各位看 ...

gmy1990 , 不能直接把MS的坐标copy过来,要把元素符号除掉,还有那个1,2 。。也要去掉,只留下坐标。。试试
timeflies..
2楼2011-05-23 16:54:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
Originally posted by enola at 2011-05-23 16:54:56:
gmy1990 , 不能直接把MS的坐标copy过来,要把元素符号除掉,还有那个1,2 。。也要去掉,只留下坐标。。试试

我试过的呀,附件里的是我最后一次尝试的POSCAR文件,我用滴是vasp5.2,看到有地方说要加元素符号,就.....照你说的试过,还是报那个错.
3楼2011-05-23 17:08:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:32:18
gmy1990(金币+1): 谢谢! 2011-05-24 12:55:11
gmy1990(金币+1): 谢谢! 2011-05-24 14:31:51
vasp5.2不需要加元素符号,加上也可以,不加直接用4.6的也没问题,关键是你加的地方不对,元素符号家在晶胞参数后面那一行,而不是原子坐标前面
心之所向无惧无悔
4楼2011-05-23 19:38:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiqi2926

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

gmy1990(金币+1): 谢谢! 2011-05-23 20:05:07
应该是元素符号的位置不对,应该在后面,如果做动力学的话,试一试siesta
6楼2011-05-23 19:43:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+3): 这样做过了,还是不行的,谢谢! 2011-05-23 21:10:00
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-05-23 21:33:00
应该是你复制过来里面有很多非unix的字符 你dos2unix一下,或者复制出来,然后再txt中黏贴在复制出来也行
嘟啦啦嘟啦啦嘟
7楼2011-05-23 20:47:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2011-05-23 19:40:28:
改成这样
ZnBPP-PE
  1
5.664000000000000      -5.664000000000000     -14.228999999999999
0.000000000000000      22.655999999999999       0.000000000000000
23.334319923239100       0.0000000 ...

这样跑过,都还是那个报错,我现在把四个文件都附上,还请纠错!谢谢!
8楼2011-05-23 21:12:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gmy1990

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
Originally posted by 贺仪 at 2011-05-23 20:47:36:
应该是你复制过来里面有很多非unix的字符 你dos2unix一下,或者复制出来,然后再txt中黏贴在复制出来也行

我把报错信息都弄全粘上来吧,

running on    8 nodes
distr:  one band on    1 nodes,    8 groups
vasp.5.2.2 15Apr09 complex
POSCAR found :  6 types and  270 ions

-----------------------------------------------------------------------------
|                                                                             |
|  ADVICE TO THIS USER RUNNING 'VASP/VAMP'   (HEAR YOUR MASTER'S VOICE ...):  |
|                                                                             |
|      You have a (more or less) 'large supercell' and for larger cells       |
|      it might be more efficient to use real space projection operators      |
|      So try LREAL= Auto  in the INCAR   file.                               |
|      Mind: If you want to do a very accurate calculations keep the          |
|      reciprocal projection scheme          (i.e. LREAL=.FALSE.)             |
|                                                                             |
-----------------------------------------------------------------------------

  No initial positions read in
9楼2011-05-23 21:17:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


gmy1990(金币+3): 现在发现POSCAR的问题了,每行都得顶格写,不能有空格,这个有点....跑了下,又有新的报错,贴在后面,还请指教! 2011-05-23 22:49:52
zzy870720z(金币+1): 谢谢提示 2011-09-09 18:20:51
dos2unix POSCAR
试一试
嘟啦啦嘟啦啦嘟
10楼2011-05-23 21:49:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gmy1990 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 281求调剂(0805) +5 烟汐忆海 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:30 by stone_128
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 材料专硕306英一数二 +10 z1z2z3879 2026-03-16 13/650 2026-03-18 14:20 by 007_lilei
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +10 曦熙兮 2026-03-15 10/500 2026-03-18 14:19 by 007_lilei
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +6 Liwangman 2026-03-15 6/300 2026-03-18 13:21 by 尽舜尧1
[考博] 环境领域全国重点实验室招收博士1-2名 +3 QGZDSYS 2026-03-13 5/250 2026-03-18 11:13 by QGZDSYS
[考研] 环境工程调剂 +8 大可digkids 2026-03-16 8/400 2026-03-18 09:36 by zhukairuo
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 11408 一志愿西电,277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 化学调剂0703 +8 啊我我的 2026-03-11 8/400 2026-03-16 17:23 by 我的船我的海
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。,。,。,。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见